More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1251 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  79.64 
 
 
389 aa  660  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  100 
 
 
392 aa  808  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  46.23 
 
 
401 aa  389  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  47.78 
 
 
382 aa  385  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  48.57 
 
 
391 aa  383  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.05 
 
 
385 aa  385  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  44.27 
 
 
382 aa  379  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  45.26 
 
 
388 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  43.19 
 
 
385 aa  370  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  46.6 
 
 
382 aa  370  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  45.7 
 
 
382 aa  368  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  48.68 
 
 
390 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.0407e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  45.24 
 
 
384 aa  367  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.14 
 
 
392 aa  363  4e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.24 
 
 
388 aa  359  6e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.53 
 
 
389 aa  357  2e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  43.98 
 
 
389 aa  355  8e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.55 
 
 
387 aa  355  1e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  44.74 
 
 
388 aa  353  4e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  43.65 
 
 
388 aa  351  1e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  4.00869e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.38 
 
 
388 aa  351  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  43.27 
 
 
390 aa  349  5e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  43.39 
 
 
390 aa  348  7e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.1377e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  42.86 
 
 
390 aa  348  1e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  43.94 
 
 
389 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  41.1 
 
 
391 aa  340  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  43.68 
 
 
400 aa  338  1e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  42.93 
 
 
402 aa  335  8e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  43.46 
 
 
403 aa  333  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  41.44 
 
 
386 aa  333  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  42.75 
 
 
384 aa  332  5e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  43.68 
 
 
391 aa  332  6e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  43.24 
 
 
399 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  44.97 
 
 
395 aa  329  5e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  43.24 
 
 
399 aa  328  7e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.57199e-05 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  42.43 
 
 
399 aa  328  9e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  46.97 
 
 
387 aa  328  1e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  42.18 
 
 
392 aa  325  9e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  42.16 
 
 
399 aa  325  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  44.95 
 
 
392 aa  322  5e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  42.7 
 
 
399 aa  322  7e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  42.43 
 
 
399 aa  322  9e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  42.43 
 
 
400 aa  321  1e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  42.43 
 
 
399 aa  321  1e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  42.43 
 
 
400 aa  321  2e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  42.33 
 
 
391 aa  320  2e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  41.91 
 
 
388 aa  320  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  42.43 
 
 
400 aa  320  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  40.36 
 
 
392 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.35509e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  40.21 
 
 
392 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  40.21 
 
 
392 aa  317  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  1.09781e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  40.21 
 
 
392 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  40.21 
 
 
392 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  40.21 
 
 
392 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  42.16 
 
 
399 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.46294e-07 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  39.85 
 
 
392 aa  317  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  41.11 
 
 
396 aa  317  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  2.1809e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  42.37 
 
 
394 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  39.69 
 
 
392 aa  315  8e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  39.95 
 
 
406 aa  313  2e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  42.11 
 
 
394 aa  314  2e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  39.69 
 
 
392 aa  313  3e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  41.78 
 
 
394 aa  312  6e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  41.84 
 
 
387 aa  312  7e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0911  class I/II aminotransferase  39.53 
 
 
400 aa  303  4e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.638659  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1447  aminotransferase class I and II  40.21 
 
 
398 aa  301  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  3.95976e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  40.32 
 
 
388 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  40.27 
 
 
409 aa  299  6e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3918  succinyldiaminopimelate transaminase  39.37 
 
 
392 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  6.86397e-05  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3869  succinyldiaminopimelate transaminase  39.9 
 
 
392 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23430  Aminotransferase, class I and II  40.27 
 
 
414 aa  296  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0018  transaminase  38.54 
 
 
394 aa  296  5e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  40 
 
 
403 aa  295  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1027  aspartate aminotransferase  39.59 
 
 
400 aa  295  1e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000262896  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  38.71 
 
 
395 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  9.67263e-06  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0944  succinyldiaminopimelate transaminase  40.81 
 
 
390 aa  294  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.989177  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  39.05 
 
 
397 aa  293  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  39.9 
 
 
402 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0840  aminotransferase  39.9 
 
 
402 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450019  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  40.16 
 
 
411 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2583  aminotransferase  40 
 
 
409 aa  293  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117889  normal  0.0369649 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  40.27 
 
 
402 aa  292  6e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  39.63 
 
 
402 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  39.73 
 
 
412 aa  292  7e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  38.58 
 
 
393 aa  292  9e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  40.27 
 
 
411 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  39.73 
 
 
412 aa  291  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  39.2 
 
 
399 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  38.79 
 
 
397 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1263  aspartate aminotransferase  39.33 
 
 
425 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  38.92 
 
 
393 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1407  aminotransferase  39.9 
 
 
413 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  40.53 
 
 
407 aa  291  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  38.92 
 
 
393 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  39.63 
 
 
402 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  40.27 
 
 
402 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  39.47 
 
 
412 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  40 
 
 
411 aa  290  4e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  39.47 
 
 
412 aa  290  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  39.47 
 
 
412 aa  290  4e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>