71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1247 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  100 
 
 		 137 aa  270  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  81.95 
 
 		 135 aa  225  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  35.04 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  31.85 
 
 		 175 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  34.01 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  32.1 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  32.62 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  24.55 
 
 		 447 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  31.21 
 
 		 257 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  30.13 
 
 		 310 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  27.89 
 
 		 185 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  25.83 
 
 		 424 aa  51.2  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  30.65 
 
 		 634 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3212  FHA domain containing protein  34.56 
 
 		 463 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.945848  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0250  hypothetical protein  28.35 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0451  RDD domain-containing protein  31.58 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  29.33 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3846  RDD domain-containing protein  25.17 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000267643  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  30.92 
 
 		 211 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3775  hypothetical protein  24.49 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000968654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4124  hypothetical protein  23.81 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000146731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1114  hypothetical protein  23.81 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000160939  normal  0.117206 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0257  hypothetical protein  27.07 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2719  RDD domain-containing protein  23.81 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000151483  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0230  hypothetical protein  26.32 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0283  hypothetical protein  27.07 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4144  hypothetical protein  23.81 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000675459  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4038  hypothetical protein  23.81 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4070  hypothetical protein  23.81 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3927  hypothetical protein  23.81 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  31.21 
 
 		 231 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3759  hypothetical protein  23.81 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.26138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4235  hypothetical protein  23.81 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0246348  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4477  RDD domain containing protein  29.79 
 
 		 174 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  27.59 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  28.87 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  28.99 
 
 		 295 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  30 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  28.09 
 
 		 247 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09620  RDD domain containing protein  28.57 
 
 		 302 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  27.01 
 
 		 270 aa  42  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  28.3 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  31.52 
 
 		 286 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  32.12 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  26.39 
 
 		 150 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  29.59 
 
 		 162 aa  42  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  26.19 
 
 		 590 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  27.86 
 
 		 285 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4625  hypothetical protein  29.31 
 
 		 383 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000286703 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  31.03 
 
 		 261 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0711  hypothetical protein  28.45 
 
 		 383 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2516  RDD domain-containing protein  28.15 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2561  RDD domain-containing protein  28.15 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.636636  normal  0.769865 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  31.3 
 
 		 668 aa  41.2  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2553  RDD domain-containing protein  28.15 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594635  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  34.02 
 
 		 266 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0595  VanZ family protein  31.9 
 
 		 384 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  29.25 
 
 		 211 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  28.99 
 
 		 169 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  27.38 
 
 		 327 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0681  hypothetical protein  29.31 
 
 		 383 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0647  hypothetical protein  29.31 
 
 		 383 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.716379  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0948  RDD domain-containing protein  31.65 
 
 		 276 aa  40.4  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000870285  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  26.53 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0736  hypothetical protein  29.31 
 
 		 383 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.02924e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0592  hypothetical protein  29.31 
 
 		 383 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0591  hypothetical protein  29.31 
 
 		 383 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.527115  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2964  hypothetical protein  28.21 
 
 		 199 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333392  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  26.12 
 
 		 316 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  29.08 
 
 		 269 aa  40  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>