More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1063 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  100 
 
 
381 aa  782    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  46.72 
 
 
381 aa  388  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  45.67 
 
 
381 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  45.93 
 
 
381 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  46.46 
 
 
381 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  46.46 
 
 
381 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  45.14 
 
 
381 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1663  hypothetical protein  46.72 
 
 
380 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0766835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1795  hypothetical protein  46.72 
 
 
380 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1843  hypothetical protein  46.46 
 
 
381 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1641  multidrug ABC transporter, permease  46.46 
 
 
381 aa  363  3e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000991751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  24.61 
 
 
380 aa  116  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2625  ABC-2 type transporter  23.47 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  20.98 
 
 
413 aa  83.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  22.93 
 
 
365 aa  79.7  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  22.4 
 
 
365 aa  79.3  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  22.34 
 
 
365 aa  77  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  23.17 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  21.74 
 
 
376 aa  72.8  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  20.77 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  20.6 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  21.12 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9218  ABC transporter  22.37 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  22.63 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  24.39 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  24.4 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  22.77 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  20.51 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  21.94 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 
375 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  30.67 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29660  ABC-type multidrug transport system, permease component  21.05 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  21.53 
 
 
371 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0017  ABC transporter, permease protein  23.2 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  21.86 
 
 
414 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  22.68 
 
 
396 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  23.46 
 
 
381 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  31.39 
 
 
251 aa  63.9  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  21.84 
 
 
369 aa  63.9  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00590  ABC-2 type transport system hypothetical protein  21.69 
 
 
380 aa  63.5  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0115211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 
366 aa  61.6  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  23.47 
 
 
375 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  22.83 
 
 
368 aa  60.8  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 
378 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 
308 aa  60.8  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  21.37 
 
 
367 aa  60.1  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 
371 aa  59.7  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0557  hypothetical protein  27.04 
 
 
379 aa  59.3  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  24.94 
 
 
368 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  26.35 
 
 
241 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  24.83 
 
 
365 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  23.08 
 
 
375 aa  59.3  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.4 
 
 
243 aa  58.9  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  24.38 
 
 
413 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4702  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 
397 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 
370 aa  59.3  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  22.6 
 
 
370 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  27.55 
 
 
376 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  21.34 
 
 
382 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3879  ABC transporter  28.24 
 
 
350 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 
371 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  24.68 
 
 
443 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 
245 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  19.94 
 
 
388 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  21.21 
 
 
376 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2513  ABC-2 type transporter  23.48 
 
 
381 aa  57.4  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.865231  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  21.71 
 
 
377 aa  57.4  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  21.46 
 
 
377 aa  57.4  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 
375 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  22.51 
 
 
375 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  23.51 
 
 
381 aa  57.4  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  19.5 
 
 
387 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.6 
 
 
384 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  26.86 
 
 
376 aa  56.6  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  21.73 
 
 
368 aa  56.6  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  24.84 
 
 
241 aa  56.2  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0811  ABC-2 type transporter  26.01 
 
 
375 aa  56.6  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  21.71 
 
 
356 aa  56.2  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  21.71 
 
 
374 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  23.93 
 
 
260 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  23.84 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  27.43 
 
 
376 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  21.74 
 
 
384 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  28.57 
 
 
378 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0074  transport protein, putative  27.13 
 
 
379 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0209  ABC-2 type transporter  22.69 
 
 
393 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223728  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0071  transport protein, putative  27.13 
 
 
379 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0633  ABC-2 type transporter  25 
 
 
259 aa  54.7  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  21.47 
 
 
384 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  24.79 
 
 
370 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  20.98 
 
 
369 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  19.35 
 
 
382 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  20.06 
 
 
379 aa  54.7  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0069  transport protein, putative  27.13 
 
 
379 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4280  transport protein, putative  27.13 
 
 
379 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1135  hypothetical protein  20.27 
 
 
384 aa  54.3  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  23.45 
 
 
369 aa  54.3  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  23.68 
 
 
377 aa  54.3  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  19.75 
 
 
379 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  25.4 
 
 
377 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>