More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1034 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  71.43 
 
 
601 aa  887  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  100 
 
 
598 aa  1227  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  48.02 
 
 
598 aa  545  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  47.85 
 
 
598 aa  546  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.25124e-06  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  48.02 
 
 
598 aa  546  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  48.02 
 
 
598 aa  547  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  48.02 
 
 
598 aa  547  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  48.02 
 
 
598 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  47.85 
 
 
598 aa  547  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  48.02 
 
 
598 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  9.94887e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  49.91 
 
 
598 aa  543  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  50.09 
 
 
571 aa  544  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  2.15576e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  47.68 
 
 
600 aa  541  1e-152  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  37.54 
 
 
598 aa  384  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  41.48 
 
 
601 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  35.39 
 
 
621 aa  368  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  41.74 
 
 
604 aa  359  8e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  41.01 
 
 
599 aa  358  2e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  36.32 
 
 
605 aa  353  4e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  36.32 
 
 
605 aa  353  4e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  35.06 
 
 
606 aa  353  5e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.52449e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  42.11 
 
 
626 aa  352  8e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  42.43 
 
 
614 aa  352  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.25747e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  36.26 
 
 
600 aa  349  9e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  36.14 
 
 
595 aa  343  7e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  39.18 
 
 
604 aa  336  7e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  44.32 
 
 
619 aa  335  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  38.32 
 
 
587 aa  331  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  39.77 
 
 
587 aa  331  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  42.18 
 
 
599 aa  331  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  42.62 
 
 
605 aa  330  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  38.96 
 
 
595 aa  328  2e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  38.03 
 
 
588 aa  327  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  41.1 
 
 
617 aa  326  8e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  39.05 
 
 
595 aa  326  8e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  41.11 
 
 
588 aa  325  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  39.78 
 
 
575 aa  323  4e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  39.52 
 
 
584 aa  323  4e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  37.94 
 
 
582 aa  323  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  9.55759e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  37.94 
 
 
582 aa  323  5e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  1.95537e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  40.91 
 
 
582 aa  323  5e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  43.75 
 
 
586 aa  323  5e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  37.94 
 
 
582 aa  323  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.22663e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  39.92 
 
 
581 aa  322  2e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  40.72 
 
 
703 aa  321  2e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  39.92 
 
 
581 aa  322  2e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  39.92 
 
 
581 aa  322  2e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  39.92 
 
 
581 aa  322  2e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.08195e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  37.25 
 
 
611 aa  320  4e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  39.71 
 
 
581 aa  320  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  37.53 
 
 
574 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.53498e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  39.43 
 
 
584 aa  319  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  38.88 
 
 
674 aa  318  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  39.6 
 
 
574 aa  318  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  36.5 
 
 
593 aa  318  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  38.65 
 
 
584 aa  317  3e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  40.81 
 
 
601 aa  317  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  37.32 
 
 
574 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  41.35 
 
 
613 aa  317  6e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  37.32 
 
 
574 aa  316  7e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  37.32 
 
 
574 aa  316  8e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  39.67 
 
 
576 aa  315  1e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  9.4448e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  39.82 
 
 
578 aa  315  1e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  38.41 
 
 
573 aa  315  2e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  35.17 
 
 
581 aa  314  2e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  39.37 
 
 
574 aa  315  2e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  39.37 
 
 
574 aa  314  3e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  38.31 
 
 
586 aa  314  3e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  40.04 
 
 
592 aa  313  5e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  37.02 
 
 
588 aa  313  5e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  39.95 
 
 
575 aa  313  6e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  39.86 
 
 
574 aa  313  6e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  7.82839e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  40.8 
 
 
584 aa  313  6e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  38.93 
 
 
574 aa  312  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  40.48 
 
 
655 aa  312  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0995  DNA primase  36.49 
 
 
610 aa  311  2e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027576  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  34.5 
 
 
596 aa  311  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  34.66 
 
 
581 aa  311  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.65097e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  41.15 
 
 
609 aa  311  3e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.33993e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  40.28 
 
 
574 aa  310  4e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  43.31 
 
 
663 aa  309  7e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  43.31 
 
 
664 aa  310  7e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  34.48 
 
 
581 aa  309  8e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  34.48 
 
 
581 aa  309  8e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  2.2434e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  34.48 
 
 
581 aa  309  8e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.06976e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  34.48 
 
 
581 aa  309  8e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  4.92318e-09  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  34.48 
 
 
581 aa  309  8e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.61356e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  34.48 
 
 
581 aa  309  8e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  38.71 
 
 
613 aa  309  9e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  36.25 
 
 
662 aa  309  1e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  37.73 
 
 
585 aa  308  2e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  34.31 
 
 
581 aa  307  5e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.72934e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  34.31 
 
 
581 aa  307  5e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  1.4553e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  43.86 
 
 
651 aa  306  8e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  42.71 
 
 
576 aa  305  1e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  39.96 
 
 
604 aa  306  1e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  37.2 
 
 
582 aa  306  1e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  33.56 
 
 
617 aa  305  1e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  39.77 
 
 
614 aa  306  1e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  43.57 
 
 
660 aa  305  1e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>