More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1017 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1144  hypothetical protein  74.66 
 
 		 448 aa  706    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  100 
 
 		 449 aa  931    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  80 
 
 		 450 aa  760    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  79.78 
 
 		 450 aa  758    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  80 
 
 		 450 aa  760    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  80 
 
 		 450 aa  760    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  79.78 
 
 		 450 aa  760    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  79.78 
 
 		 450 aa  758    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  80 
 
 		 450 aa  760    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  73.91 
 
 		 448 aa  692    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  79.78 
 
 		 450 aa  760    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  79.55 
 
 		 450 aa  759    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  73.91 
 
 		 448 aa  692    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  80.22 
 
 		 450 aa  761    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  80 
 
 		 450 aa  759    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  90.47 
 
 		 451 aa  853    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1992  MiaB-like tRNA modifying enzyme  54.8 
 
 		 471 aa  506  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.130467  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  52.79 
 
 		 435 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  48.46 
 
 		 436 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0588  MiaB-like tRNA modifying enzyme  52.97 
 
 		 450 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1333  MiaB-like tRNA modifying enzyme  48.45 
 
 		 449 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  48.16 
 
 		 434 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2241  RNA modification enzyme, MiaB family  46.3 
 
 		 454 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150078  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  45.89 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  51.15 
 
 		 439 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  47.43 
 
 		 450 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  45.18 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  43.75 
 
 		 434 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2282  MiaB-like tRNA modifying enzyme  43.52 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  43.61 
 
 		 431 aa  358  9e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0223  hypothetical protein  41.88 
 
 		 441 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.180201 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  45.28 
 
 		 437 aa  348  8e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2299  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.79 
 
 		 466 aa  347  3e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.198843  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1770  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.96 
 
 		 435 aa  347  3e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000207484  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2937  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.35 
 
 		 439 aa  343  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  42.15 
 
 		 446 aa  343  2.9999999999999997e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.82 
 
 		 456 aa  341  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000454579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5039  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.31 
 
 		 444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  44.86 
 
 		 441 aa  336  5e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.95 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2570  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.43 
 
 		 429 aa  333  4e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1737  2-methylthioadenine synthetase  41.51 
 
 		 438 aa  332  1e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0174  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.81 
 
 		 430 aa  330  4e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09066  putative Fe-S oxidoreductase  41.16 
 
 		 458 aa  330  4e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276137  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40 
 
 		 438 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2224  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.57 
 
 		 442 aa  326  5e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.490633  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0874  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.68 
 
 		 431 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6578  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.52 
 
 		 425 aa  322  6e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.745679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.3 
 
 		 432 aa  319  5e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2568  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.79 
 
 		 434 aa  317  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1490  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.79 
 
 		 444 aa  315  9e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0444  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.92 
 
 		 442 aa  315  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1350  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.92 
 
 		 449 aa  307  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  36.28 
 
 		 471 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.34792  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1331  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.63 
 
 		 417 aa  293  4e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000562047  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0422  RNA modification protein  39.86 
 
 		 446 aa  290  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0536856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1889  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  36.28 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000213731  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11680  RNA modification enzyme, MiaB family  35.84 
 
 		 450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0952269  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0352  RNA modification enzyme, MiaB family  39.68 
 
 		 458 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.135679  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2207  RNA modification enzyme, MiaB family  35.93 
 
 		 440 aa  286  5.999999999999999e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1728  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.34 
 
 		 438 aa  285  8e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.479022  decreased coverage  0.00502843 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2316  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.29 
 
 		 427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1349  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.89 
 
 		 447 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1156  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.89 
 
 		 447 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.516492  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0549  RNA modification protein  35.96 
 
 		 443 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3871  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  36.14 
 
 		 509 aa  280  4e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0166  RNA modification protein  37.79 
 
 		 440 aa  280  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.684419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0783  RNA modification protein  34.17 
 
 		 480 aa  280  4e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.2 
 
 		 434 aa  279  9e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1484  RNA modification enzyme, MiaB family  34.4 
 
 		 497 aa  279  9e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2221  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.28 
 
 		 444 aa  278  1e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000670309 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1428  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.91 
 
 		 509 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3819  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.91 
 
 		 509 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1211  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.76 
 
 		 495 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.496163 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38 
 
 		 420 aa  277  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3806  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.91 
 
 		 509 aa  277  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3784  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.91 
 
 		 509 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0126107 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.73 
 
 		 434 aa  276  4e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3513  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.91 
 
 		 509 aa  276  5e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.325275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3531  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.91 
 
 		 509 aa  276  5e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3543  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.6 
 
 		 509 aa  276  8e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0128705  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2599  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  36.2 
 
 		 487 aa  275  8e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000474817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3621  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.45 
 
 		 509 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3908  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.45 
 
 		 509 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1495  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  34.03 
 
 		 451 aa  273  4.0000000000000004e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.421573  hitchhiker  0.000974888 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1790  RNA modification enzyme, MiaB family  36.76 
 
 		 452 aa  273  5.000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0115132  normal  0.0236064 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1197  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.37 
 
 		 523 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000761282  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2092  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.09 
 
 		 531 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2424  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.23 
 
 		 509 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2738  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.52 
 
 		 447 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000461297  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1488  RNA modification protein  37.44 
 
 		 497 aa  271  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1018  RNA modification enzyme, MiaB family  35.45 
 
 		 449 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.657516  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.66 
 
 		 421 aa  269  7e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.82 
 
 		 429 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  36.19 
 
 		 447 aa  268  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2123  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  33.94 
 
 		 451 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000417118  normal  0.0490217 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1352  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.29 
 
 		 514 aa  266  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1378  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.29 
 
 		 514 aa  266  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1996  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.44 
 
 		 451 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0789  tRNA 2-methylthioadenosine synthase  35.82 
 
 		 411 aa  265  1e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.594901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>