More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0982 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  100 
 
 		 245 aa  494  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  90.68 
 
 		 236 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  78.11 
 
 		 237 aa  380  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  78.11 
 
 		 237 aa  380  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  78.11 
 
 		 237 aa  380  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  78.11 
 
 		 237 aa  380  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  78.11 
 
 		 237 aa  380  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  78.11 
 
 		 237 aa  380  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  78.11 
 
 		 237 aa  380  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  78.11 
 
 		 237 aa  380  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  78.35 
 
 		 237 aa  378  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  78.11 
 
 		 265 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  57.33 
 
 		 239 aa  281  5.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  62.9 
 
 		 226 aa  278  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  62.88 
 
 		 234 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  57.2 
 
 		 249 aa  263  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  58.67 
 
 		 244 aa  261  6.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  56.65 
 
 		 256 aa  261  8.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  54.22 
 
 		 231 aa  238  8e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  59.36 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  78.72 
 
 		 149 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  53.98 
 
 		 232 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  52.78 
 
 		 233 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  52.78 
 
 		 233 aa  218  8.999999999999998e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  56.77 
 
 		 207 aa  218  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  53.33 
 
 		 219 aa  207  9e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  50.99 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  50.5 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  50.5 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  50.5 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  50.5 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  50.5 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  50.5 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  50.5 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  50.5 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  50.5 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  50.5 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  52.94 
 
 		 241 aa  202  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  49.52 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  49.5 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  50.46 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  49.5 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  50 
 
 		 241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  47.98 
 
 		 240 aa  194  8.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  44.49 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  44.49 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  49.03 
 
 		 241 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  46.83 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  48.54 
 
 		 243 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  50.49 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  48.86 
 
 		 243 aa  189  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  45.59 
 
 		 241 aa  188  5.999999999999999e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  48.8 
 
 		 246 aa  188  8e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  49.04 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  47.51 
 
 		 244 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  46.08 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  42.79 
 
 		 232 aa  178  8e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  65.52 
 
 		 118 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  63.72 
 
 		 114 aa  155  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4361  RNA polymerase sigma-K factor  77.08 
 
 		 100 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  60.91 
 
 		 126 aa  138  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  57.14 
 
 		 118 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1737  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  49.07 
 
 		 113 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0277937 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  31.87 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1203  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  32.05 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512753  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0863  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  35.15 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2066  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  32.93 
 
 		 259 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000506599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  32.79 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  34.03 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  31.97 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  35.19 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0687  sporulation sigma factor SigG  34.04 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0937  RNA polymerase sigma-70 factor family protein  29.77 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1291  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  29.32 
 
 		 259 aa  99.4  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3730  sporulation sigma factor SigG  31.98 
 
 		 292 aa  99  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  31.95 
 
 		 257 aa  98.6  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3442  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  33.74 
 
 		 261 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3917  sporulation sigma factor SigG  31.58 
 
 		 259 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000372162 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4004  sporulation sigma factor SigG  31.58 
 
 		 259 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1237  sporulation sigma factor SigG  31.58 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4042  sporulation sigma factor SigG  31.58 
 
 		 259 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000307551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3955  sporulation sigma factor SigG  31.58 
 
 		 259 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000614575  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  30.89 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3948  sporulation sigma factor SigG  31.58 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000196829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3754  sporulation sigma factor SigG  31.58 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000419985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3645  sporulation sigma factor SigG  31.58 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74076e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3662  sporulation sigma factor SigG  31.58 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000167357  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0930  RpoD family RNA polymerase sigma factor  29.43 
 
 		 332 aa  96.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1436  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  28.42 
 
 		 344 aa  96.3  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121871  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2014  sporulation sigma factor SigG  31.12 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1732  sporulation sigma factor SigG  31.12 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0249664  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0836  sporulation sigma factor SigG  31.06 
 
 		 234 aa  95.9  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.904059  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1901  sporulation sigma factor SigG  31.91 
 
 		 259 aa  95.5  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1031  sporulation sigma factor SigG  31.17 
 
 		 259 aa  95.5  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000174079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2552  sporulation sigma factor SigG  31.17 
 
 		 259 aa  95.5  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000004552  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  32.81 
 
 		 255 aa  95.5  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3020  RNA polymerase sigma factor RpoS  27.67 
 
 		 335 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000209414 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2284  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  33.33 
 
 		 249 aa  95.1  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0448  sporulation sigma factor SigG  33.2 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243038  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4053  sporulation sigma factor SigG  31.64 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000132793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>