More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0972 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 158 aa  314  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  96.84 
 
 		 159 aa  305  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  79.11 
 
 		 158 aa  253  7e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  78.48 
 
 		 158 aa  251  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  78.48 
 
 		 158 aa  251  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  77.85 
 
 		 158 aa  249  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  77.85 
 
 		 158 aa  249  8.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  77.85 
 
 		 158 aa  249  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  77.85 
 
 		 175 aa  249  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  77.85 
 
 		 158 aa  249  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  77.85 
 
 		 175 aa  249  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  77.85 
 
 		 175 aa  249  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  76.58 
 
 		 175 aa  246  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  69.81 
 
 		 158 aa  194  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  63.64 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  61.29 
 
 		 160 aa  190  5e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  67.3 
 
 		 158 aa  189  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  67.3 
 
 		 158 aa  189  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  61.49 
 
 		 160 aa  181  3e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  58.22 
 
 		 162 aa  175  2e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  53.85 
 
 		 158 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  53.85 
 
 		 158 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  58.6 
 
 		 158 aa  171  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  56.49 
 
 		 160 aa  169  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  58 
 
 		 157 aa  167  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 		 161 aa  164  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  54.43 
 
 		 159 aa  163  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  55.19 
 
 		 160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  58.44 
 
 		 160 aa  161  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  55.48 
 
 		 156 aa  154  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  52.63 
 
 		 162 aa  153  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  50.32 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  52.94 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  54.19 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  51.9 
 
 		 157 aa  147  7e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  51.77 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  51.95 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  52 
 
 		 154 aa  143  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  49.03 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 163 aa  142  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  52.7 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  51.03 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  52.29 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  52.94 
 
 		 156 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  45.57 
 
 		 157 aa  133  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  47.4 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  47.17 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  48.03 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0116  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 164 aa  130  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000184686  hitchhiker  0.00194606 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 154 aa  130  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  48.12 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  48.59 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  45.16 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  47.92 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  47.4 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  47.4 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  47.02 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  46.9 
 
 		 166 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  46.9 
 
 		 166 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  46.9 
 
 		 166 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  43.14 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 		 152 aa  127  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 158 aa  127  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  44.83 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  46.85 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000032178  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl102  transcription elongation factor GreA  47.14 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1188  transcription elongation factor GreA  46.05 
 
 		 159 aa  123  8.000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00439545  normal  0.0602948 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  42.58 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  46.43 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  48.72 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  45.03 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3615  transcription elongation factor GreA  45.7 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000143014  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>