278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0901 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
288 aa  579  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  78.82 
 
 
288 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  58.55 
 
 
283 aa  338  4e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  58.01 
 
 
285 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  56.07 
 
 
283 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  57.14 
 
 
283 aa  333  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  56.43 
 
 
283 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  56.43 
 
 
283 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  55.71 
 
 
283 aa  327  9e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  55.71 
 
 
283 aa  324  9e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  55 
 
 
283 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  55 
 
 
283 aa  323  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  55 
 
 
283 aa  322  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  39.49 
 
 
280 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  39.49 
 
 
280 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  39.57 
 
 
279 aa  191  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  37.23 
 
 
283 aa  185  9e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  34.47 
 
 
285 aa  179  4.999999999999999e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4663  rod shape-determining protein MreC  38.29 
 
 
255 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  30.99 
 
 
285 aa  169  5e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  33.94 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0286  rod shape-determining protein MreC  37.22 
 
 
253 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  38.06 
 
 
317 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  31.91 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  32.72 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  32.84 
 
 
304 aa  142  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2536  rod shape-determining protein MreC  31.8 
 
 
291 aa  138  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  34.32 
 
 
274 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  29.93 
 
 
288 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  32.58 
 
 
271 aa  123  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  30.69 
 
 
275 aa  123  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 
285 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  31.29 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  38.35 
 
 
273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  29.09 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  28.73 
 
 
283 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  31.76 
 
 
357 aa  115  6e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  29.14 
 
 
277 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  30.21 
 
 
274 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 
283 aa  109  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  28.25 
 
 
287 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  27.88 
 
 
286 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  31.87 
 
 
274 aa  106  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  27.21 
 
 
277 aa  105  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  31.27 
 
 
274 aa  105  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  31.37 
 
 
272 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  30.52 
 
 
273 aa  102  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  30.11 
 
 
276 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 
274 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0040  rod shape-determining protein MreC  29.32 
 
 
276 aa  96.7  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  37.37 
 
 
243 aa  96.7  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
281 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  29.22 
 
 
285 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  33.48 
 
 
359 aa  94  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 
278 aa  90.1  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  28.19 
 
 
292 aa  90.1  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  31.02 
 
 
283 aa  89.4  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  27.86 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  31.89 
 
 
315 aa  85.5  8e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  27.56 
 
 
351 aa  85.5  8e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  29.37 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  29.95 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  32.16 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  30.34 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  30.9 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  30.22 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  30.83 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  26.69 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  26.69 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2659  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  29.28 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4600  rod shape-determining protein MreC  28.75 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  29.28 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  29.28 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  34.62 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1457  rod shape-determining protein MreC  32.04 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  31.84 
 
 
407 aa  79.3  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  26.67 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  29.66 
 
 
362 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  28.29 
 
 
281 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  26.28 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00570  rod shape-determining protein  26.2 
 
 
257 aa  78.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119359  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  31.07 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  28.11 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  28.1 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  29.88 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1317  rod shape-determining protein MreC  27.1 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0592341  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  33.11 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  28.52 
 
 
311 aa  77  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  30.15 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  31.31 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  29.95 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  29.07 
 
 
286 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1282  rod shape-determining protein MreC  31.88 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1686  rod shape-determining protein MreC  33.16 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.134471 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  24.34 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17471  rod shape-determining protein MreC  30.45 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>