79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0876 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0876  stage VI sporulation protein D  100 
 
 		 351 aa  698    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2576  stage VI sporulation protein D  70.21 
 
 		 431 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4551  stage VI sporulation protein D, putative  37.18 
 
 		 325 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4305  sporulation stage VI protein D  43.85 
 
 		 325 aa  145  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4578  putative stage VI sporulation protein D  48.57 
 
 		 326 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4193  stage VI sporulation protein D  48.2 
 
 		 325 aa  143  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0656  putative stage VI sporulation protein D  48.92 
 
 		 323 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4204  stage VI sporulation protein D  47.86 
 
 		 329 aa  142  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4596  putative stage VI sporulation protein D  47.86 
 
 		 327 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4357  stage VI sporulation protein D  47.86 
 
 		 327 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4692  stage VI sporulation protein D  47.86 
 
 		 327 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4547  putative stage VI sporulation protein D  47.86 
 
 		 327 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3176  sporulation stage VI protein D  50 
 
 		 334 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  48.94 
 
 		 128 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0922  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  50 
 
 		 75 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.005941  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  46.51 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  37.93 
 
 		 751 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  38.3 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  48 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.07 
 
 		 289 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.14 
 
 		 612 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  53.85 
 
 		 361 aa  47.8  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0050  Peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 507 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  35.14 
 
 		 612 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  34.74 
 
 		 515 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  46.81 
 
 		 466 aa  47  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  34.88 
 
 		 534 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  38 
 
 		 428 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  44.68 
 
 		 428 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  53.33 
 
 		 202 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  44.68 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  38.78 
 
 		 409 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  53.33 
 
 		 203 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  33.93 
 
 		 520 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0337  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.51 
 
 		 472 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000027639  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3314  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.37 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000664916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2149  peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 		 709 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 159 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 		 430 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21400  Peptidoglycan-binding LysM  44.19 
 
 		 500 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  32.31 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  43.48 
 
 		 191 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4365  Peptidoglycan-binding LysM  40.91 
 
 		 229 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  52.38 
 
 		 503 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  42 
 
 		 470 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  41.3 
 
 		 471 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  44 
 
 		 284 aa  45.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2528  spore coat assembly protein SafA  43.75 
 
 		 432 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  42.86 
 
 		 430 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 168 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  42.86 
 
 		 430 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  42.86 
 
 		 430 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 		 430 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  42.86 
 
 		 430 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  42.86 
 
 		 430 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.86 
 
 		 327 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  42.86 
 
 		 430 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3208  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  54.76 
 
 		 455 aa  43.9  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058641  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  41.86 
 
 		 337 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  45.24 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  40.82 
 
 		 430 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  47.73 
 
 		 620 aa  43.5  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  38.3 
 
 		 754 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  40.82 
 
 		 430 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0570  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.85 
 
 		 452 aa  43.5  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000754253 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2827  Peptidoglycan-binding LysM  39.53 
 
 		 130 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  31.4 
 
 		 546 aa  43.1  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  35.14 
 
 		 503 aa  43.1  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00646  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase II, murein hydrolase  34.21 
 
 		 477 aa  43.1  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  44.9 
 
 		 301 aa  43.1  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  42.22 
 
 		 499 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0590  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 		 389 aa  42.7  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0600559  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2670  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.84 
 
 		 447 aa  42.7  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.2261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  41.86 
 
 		 175 aa  42.7  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  35.85 
 
 		 464 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  35.48 
 
 		 618 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  44.19 
 
 		 250 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1306  CHAP domain-containing protein  30.26 
 
 		 372 aa  42.7  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.387302  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1331  CHAP domain-containing protein  30.26 
 
 		 372 aa  42.7  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>