More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0864 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  89.02 
 
 
428 aa  744    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  100 
 
 
428 aa  846    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  73.77 
 
 
427 aa  622  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  72.17 
 
 
425 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  71.93 
 
 
425 aa  600  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  71.7 
 
 
425 aa  600  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  71.7 
 
 
425 aa  600  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  71.7 
 
 
425 aa  600  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  71.7 
 
 
425 aa  600  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  71.7 
 
 
425 aa  600  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  71.7 
 
 
425 aa  600  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  71.7 
 
 
425 aa  600  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  71.23 
 
 
425 aa  599  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  60.47 
 
 
433 aa  528  1e-148  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  59.29 
 
 
433 aa  514  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  59.29 
 
 
433 aa  514  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  53.72 
 
 
435 aa  449  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  51.76 
 
 
436 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  52.68 
 
 
435 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  55.35 
 
 
446 aa  432  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  51.05 
 
 
426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  50 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  49.07 
 
 
428 aa  403  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  48.72 
 
 
427 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  50 
 
 
449 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  51.98 
 
 
427 aa  397  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  48.83 
 
 
427 aa  398  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  48.94 
 
 
446 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  48.36 
 
 
428 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  48.24 
 
 
428 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  45.81 
 
 
432 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  50.93 
 
 
438 aa  376  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  44.73 
 
 
438 aa  378  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  45.22 
 
 
435 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  47.2 
 
 
431 aa  360  3e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  44.52 
 
 
439 aa  352  7e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  41.96 
 
 
438 aa  348  1e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  45.9 
 
 
428 aa  326  5e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  45.9 
 
 
428 aa  324  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  42.99 
 
 
451 aa  310  4e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  41.22 
 
 
430 aa  293  5e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  39.52 
 
 
488 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  40.6 
 
 
478 aa  278  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  39.26 
 
 
433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  38.52 
 
 
435 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  38.14 
 
 
439 aa  272  7e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  37.96 
 
 
435 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  37.12 
 
 
433 aa  270  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  37.38 
 
 
431 aa  260  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  40.62 
 
 
433 aa  259  7e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  36.83 
 
 
424 aa  253  7e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  35.36 
 
 
500 aa  248  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  35.08 
 
 
442 aa  245  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  37.02 
 
 
430 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  34.85 
 
 
448 aa  232  8.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  36.21 
 
 
429 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  36.36 
 
 
429 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl405  trigger factor, prolyl isomerase  32.94 
 
 
426 aa  229  5e-59  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  32.18 
 
 
437 aa  229  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  35.89 
 
 
429 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  32.41 
 
 
440 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  32.29 
 
 
471 aa  223  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  32.4 
 
 
447 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  33.26 
 
 
435 aa  223  7e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  31.46 
 
 
460 aa  222  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  35.29 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  35.44 
 
 
461 aa  219  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  32.56 
 
 
448 aa  219  8.999999999999998e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  34.18 
 
 
434 aa  217  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  32.56 
 
 
447 aa  216  9e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  32.5 
 
 
485 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  35.62 
 
 
435 aa  213  5.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  31.73 
 
 
500 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1894  trigger factor  32.94 
 
 
432 aa  212  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  32.65 
 
 
452 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  31.93 
 
 
483 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  33.1 
 
 
481 aa  210  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf857  trigger factor (prolyl isomerase)  32.43 
 
 
473 aa  210  5e-53  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  31.08 
 
 
455 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  31.08 
 
 
455 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  32.17 
 
 
463 aa  209  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  33.87 
 
 
444 aa  208  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  31.79 
 
 
445 aa  208  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  35.88 
 
 
435 aa  208  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  35.13 
 
 
434 aa  207  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  35.29 
 
 
433 aa  207  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  31.58 
 
 
435 aa  206  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  32.93 
 
 
432 aa  206  8e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1291  trigger factor  32.74 
 
 
434 aa  206  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0308812 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  34.67 
 
 
518 aa  205  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  35.43 
 
 
432 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  32.8 
 
 
512 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1253  trigger factor  31.12 
 
 
472 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  29.31 
 
 
479 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  33.84 
 
 
432 aa  203  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  33.84 
 
 
432 aa  203  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  33.84 
 
 
432 aa  203  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  34.69 
 
 
436 aa  203  5e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  33.84 
 
 
432 aa  203  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  33.84 
 
 
432 aa  203  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>