More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0860 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
371 aa  751    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  79.25 
 
 
371 aa  617  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.64 
 
 
373 aa  442  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.1 
 
 
357 aa  439  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.91 
 
 
363 aa  437  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.41 
 
 
356 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.63 
 
 
357 aa  434  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2226  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.5 
 
 
359 aa  433  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.02 
 
 
360 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.02 
 
 
360 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.02 
 
 
360 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.3 
 
 
360 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.48 
 
 
357 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.86 
 
 
360 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.69 
 
 
358 aa  421  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.43 
 
 
362 aa  424  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.49 
 
 
356 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1958  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.66 
 
 
367 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1546  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.08 
 
 
373 aa  421  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178342  normal  0.073036 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.21 
 
 
352 aa  419  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.17 
 
 
360 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.52 
 
 
358 aa  418  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3358  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.83 
 
 
360 aa  421  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.89 
 
 
357 aa  419  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.06 
 
 
357 aa  418  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1539  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.89 
 
 
357 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.77 
 
 
359 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.89 
 
 
360 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.29 
 
 
355 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.3 
 
 
360 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.15 
 
 
358 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1483  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.6 
 
 
357 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.607612  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.76 
 
 
360 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0972  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.24 
 
 
362 aa  412  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1100  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.44 
 
 
363 aa  411  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.757445  normal  0.166084 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2252  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.36 
 
 
357 aa  414  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.89 
 
 
360 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.45 
 
 
358 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.04 
 
 
360 aa  411  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.47 
 
 
360 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.29 
 
 
356 aa  404  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.07 
 
 
350 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1886  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.83 
 
 
353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2070  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.54 
 
 
353 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3900  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.15 
 
 
373 aa  407  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4657  3-isopropylmalate dehydrogenase  58 
 
 
364 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431802 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.98 
 
 
354 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.59 
 
 
357 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.7 
 
 
362 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1754  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.89 
 
 
354 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.994905 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5238  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.82 
 
 
356 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37874 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.21 
 
 
355 aa  402  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1807  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.26 
 
 
353 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.833313  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1047  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.7 
 
 
357 aa  398  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0347  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.39 
 
 
361 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.7 
 
 
358 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.7 
 
 
358 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1014  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.31 
 
 
362 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.43 
 
 
356 aa  398  9.999999999999999e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.19 
 
 
357 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1703  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.76 
 
 
351 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.112603  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.39 
 
 
361 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.93 
 
 
357 aa  398  9.999999999999999e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1420  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.52 
 
 
362 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3775  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.94 
 
 
358 aa  396  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  hitchhiker  0.00333636 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1920  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.07 
 
 
353 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2987  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.3 
 
 
362 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.372327 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2066  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.38 
 
 
363 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1793  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.71 
 
 
356 aa  396  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1901  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.98 
 
 
352 aa  392  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.81 
 
 
357 aa  394  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1054  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.98 
 
 
356 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1341  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.07 
 
 
357 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.7 
 
 
357 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1221  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.42 
 
 
357 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0144759 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.7 
 
 
359 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.57 
 
 
355 aa  389  1e-107  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1677  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.77 
 
 
367 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.81 
 
 
357 aa  390  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.52 
 
 
353 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1720  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.11 
 
 
353 aa  388  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.424747 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0364  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.08 
 
 
354 aa  390  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.71 
 
 
379 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197257  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0597  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.58 
 
 
523 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000598819  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2173  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.57 
 
 
352 aa  390  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0381  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.08 
 
 
354 aa  390  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1323  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.47 
 
 
354 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1230  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.66 
 
 
361 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121054 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0767  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.42 
 
 
356 aa  389  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09751  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.39 
 
 
360 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.945321  hitchhiker  0.00220334 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3890  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.04 
 
 
354 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.44 
 
 
356 aa  389  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001657  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.71 
 
 
363 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1521  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.76 
 
 
354 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0593  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.66 
 
 
363 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1454  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.47 
 
 
354 aa  385  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1560  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.47 
 
 
354 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0788  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.66 
 
 
357 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2487  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.47 
 
 
352 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0391  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.71 
 
 
358 aa  385  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>