More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0847 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
147 aa  297  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  57.5 
 
 
154 aa  148  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  54.17 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  43.2 
 
 
168 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 
141 aa  93.2  9e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  42.73 
 
 
142 aa  84.7  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  32.2 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
156 aa  67  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  37.01 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  36.44 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  36.22 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
160 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  28.46 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
163 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
160 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
160 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
160 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  28 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
168 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
149 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
160 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 
168 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  43.24 
 
 
159 aa  61.6  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  52.38 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
152 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 
152 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
149 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  25.78 
 
 
187 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  36.36 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
172 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
173 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 
150 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 
152 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
177 aa  60.5  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
155 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
151 aa  60.5  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
152 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 
152 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
152 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
152 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 
152 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
171 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  41.98 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0515  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 
163 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.628679  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  40.7 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
147 aa  58.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  27.14 
 
 
177 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
165 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  41.98 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  41.98 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 
161 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
173 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
152 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
165 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  27.21 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  39.78 
 
 
183 aa  57  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
170 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
165 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  41.79 
 
 
162 aa  57  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>