More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0819 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 
221 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  91.78 
 
 
221 aa  418  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  58.18 
 
 
223 aa  259  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  48.65 
 
 
224 aa  218  7e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  46.22 
 
 
267 aa  209  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.51 
 
 
242 aa  205  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.67 
 
 
230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.79 
 
 
232 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0640  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.09 
 
 
231 aa  189  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500929  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.79 
 
 
230 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0944  ThiJ/PfpI family protein  44.29 
 
 
219 aa  189  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  42.79 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.36 
 
 
230 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.79 
 
 
238 aa  188  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  44.05 
 
 
230 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  44.49 
 
 
230 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  42.29 
 
 
245 aa  184  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.85 
 
 
229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.56 
 
 
228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  40.18 
 
 
267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  42.15 
 
 
227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  42.22 
 
 
257 aa  179  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  43.87 
 
 
229 aa  177  9e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  42.15 
 
 
227 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  43.36 
 
 
246 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3319  ThiJ/PfpI  41.41 
 
 
227 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262803  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5801  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.33 
 
 
227 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  0.558329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  44.34 
 
 
224 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.05 
 
 
227 aa  176  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  41.41 
 
 
225 aa  175  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4224  thiJ/PfpI family protein  42.08 
 
 
220 aa  175  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4361  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.92 
 
 
228 aa  175  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  40 
 
 
230 aa  174  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6825  ThiJ/PfpI domain protein  41.15 
 
 
233 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.397498 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.07 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9266  predicted protein  41.89 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774425  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5542  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.09 
 
 
224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  40.26 
 
 
230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  41.63 
 
 
220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15940  putative intracellular protease/amidase  43.11 
 
 
227 aa  172  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.581968  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.44 
 
 
231 aa  172  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.07 
 
 
225 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3545  ThiJ/PfpI family protein  40.18 
 
 
225 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.809418  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  41.15 
 
 
230 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4383  thiJ/pfpI family protein  41.18 
 
 
220 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  41.52 
 
 
225 aa  170  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4722  thiJ/pfpI family protein  41.18 
 
 
220 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.477028  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0791  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.86 
 
 
229 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0627  thiJ/pfpI family protein  41.1 
 
 
219 aa  169  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  41.07 
 
 
225 aa  169  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4593  thiJ/pfpI family protein  42.06 
 
 
220 aa  168  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  40 
 
 
229 aa  168  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4627  thiJ/pfpI family protein  40.72 
 
 
220 aa  168  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0745  Fis family transcriptional regulator  41.07 
 
 
226 aa  168  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.73 
 
 
225 aa  167  9e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0819  ThiJ/PfpI domain protein  41.1 
 
 
230 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4797  ThiJ/PfpI domain protein  38.29 
 
 
223 aa  166  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  hitchhiker  0.0019745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4837  ThiJ/PfpI domain protein  42.48 
 
 
227 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3190  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.8 
 
 
237 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.687105  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.01 
 
 
225 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40 
 
 
227 aa  166  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5679  ThiJ/PfpI  39.06 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6043  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.06 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0569087 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1750  ThiJ/PfpI  38.84 
 
 
226 aa  165  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.45981  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4578  thiJ/pfpI family protein  40.27 
 
 
220 aa  165  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1724  ThiJ/PfpI  39.01 
 
 
225 aa  165  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02417  ThiJ/PfpI family protein  40.72 
 
 
232 aa  165  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.847717  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3087  ThiJ/PfpI domain protein  37.5 
 
 
230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00619766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3240  ThiJ/PfpI domain protein  43.27 
 
 
233 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5032  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.93 
 
 
237 aa  164  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.848966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1020  ThiJ/PfpI domain protein  42.31 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.276045  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0227  ThiJ/PfpI family protein  40.35 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.55 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  39.91 
 
 
228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0349  ThiJ/PfpI domain protein  38.84 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.5 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2821  ThiJ/PfpI domain protein  40.61 
 
 
227 aa  162  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.63 
 
 
232 aa  162  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  38.84 
 
 
225 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2230  ThiJ/PfpI  38.94 
 
 
225 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.346275  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1312  ThiJ/PfpI  41.07 
 
 
227 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0093  ThiJ/PfpI  40.27 
 
 
231 aa  160  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  37.5 
 
 
226 aa  159  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3997  hypothetical protein  38.79 
 
 
228 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29000  hypothetical protein  39.91 
 
 
228 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000723683 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1352  ThiJ/PfpI domain protein  38.12 
 
 
225 aa  159  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  41.7 
 
 
230 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7474  ThiJ/PfpI family protein  39.21 
 
 
227 aa  158  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.09 
 
 
228 aa  158  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  38.77 
 
 
228 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3360  ThiJ/PfpI domain protein  43.44 
 
 
226 aa  155  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00683077  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0479  NonF-related protein  41.63 
 
 
229 aa  156  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4674  ThiJ/PfpI domain protein  39.65 
 
 
227 aa  156  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4305  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.17 
 
 
231 aa  155  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377734  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4178  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.65 
 
 
228 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  37.89 
 
 
226 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  37.89 
 
 
226 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  37.89 
 
 
226 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  37.89 
 
 
226 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  37.89 
 
 
226 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>