More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0793 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 
153 aa  303  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  89.54 
 
 
153 aa  279  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  80.67 
 
 
153 aa  251  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  80 
 
 
153 aa  248  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  80 
 
 
153 aa  248  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  80 
 
 
153 aa  248  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  80 
 
 
153 aa  248  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  80 
 
 
153 aa  248  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  80 
 
 
153 aa  248  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  80 
 
 
153 aa  248  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  80 
 
 
153 aa  248  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  80 
 
 
153 aa  248  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  80 
 
 
153 aa  248  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  58.39 
 
 
154 aa  196  7e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  58.78 
 
 
153 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  52.67 
 
 
154 aa  194  5.000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  56.38 
 
 
149 aa  190  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  56.38 
 
 
149 aa  190  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  55.92 
 
 
158 aa  189  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  56.76 
 
 
151 aa  189  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  54.25 
 
 
156 aa  184  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  59.33 
 
 
150 aa  184  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  57.24 
 
 
153 aa  183  6e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  59.06 
 
 
151 aa  183  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  55.03 
 
 
154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  58.39 
 
 
158 aa  180  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  53.59 
 
 
156 aa  180  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  53.59 
 
 
156 aa  180  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  55.03 
 
 
159 aa  179  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  59.18 
 
 
150 aa  176  7e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  59.06 
 
 
163 aa  176  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1623  transcriptional regulator NrdR  54.67 
 
 
159 aa  175  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00056172  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 
150 aa  174  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 
156 aa  174  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  52.32 
 
 
157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  51.33 
 
 
155 aa  169  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  57.33 
 
 
176 aa  168  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 
153 aa  167  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 
147 aa  167  7e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  53.33 
 
 
150 aa  166  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  56 
 
 
150 aa  166  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  53.33 
 
 
150 aa  166  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  54 
 
 
150 aa  166  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  54 
 
 
150 aa  166  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0266  transcriptional regulator NrdR  60.67 
 
 
154 aa  165  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  48.98 
 
 
148 aa  164  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  52.67 
 
 
150 aa  164  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0794  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 
148 aa  164  5.9999999999999996e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.610189  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10820  transcriptional regulator NrdR  53.38 
 
 
149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  unclonable  0.00000000140885 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  49.66 
 
 
148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03481  transcriptional regulator NrdR  50.69 
 
 
157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  56 
 
 
150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22151  transcriptional regulator NrdR  52.08 
 
 
158 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 
163 aa  160  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  54 
 
 
162 aa  160  9e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 
151 aa  158  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1690  transcriptional regulator NrdR  51.95 
 
 
159 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  51.33 
 
 
155 aa  158  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  51.33 
 
 
155 aa  158  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  52.35 
 
 
154 aa  159  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  51.33 
 
 
156 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04031  transcriptional regulator NrdR  51.95 
 
 
159 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.5904 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  50.66 
 
 
152 aa  158  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1866  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 
158 aa  157  4e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.610385  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  50.66 
 
 
152 aa  157  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 
180 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0323  transcriptional regulator NrdR  50.31 
 
 
175 aa  157  7e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000111081  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  52.38 
 
 
184 aa  156  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
NC_002936  DET0344  transcriptional regulator NrdR  50.68 
 
 
175 aa  156  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0225239  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 
150 aa  155  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  50.67 
 
 
174 aa  155  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  52.94 
 
 
154 aa  155  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  50.33 
 
 
157 aa  154  4e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  50.33 
 
 
157 aa  154  4e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_285  transcriptional regulator  48.43 
 
 
175 aa  153  7e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000377399  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  49.67 
 
 
155 aa  153  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4664  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  48.3 
 
 
175 aa  153  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280022  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0838  ATP-cone domain protein  50.34 
 
 
163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
149 aa  150  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3071  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 
179 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3049  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 
179 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000710191  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
149 aa  150  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
149 aa  150  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
149 aa  150  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1161  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 
149 aa  150  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000702599  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1330  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 
151 aa  149  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.768673  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1381  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 
149 aa  149  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00201754  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1826  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
152 aa  149  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0898017  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 
149 aa  149  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1034  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 
149 aa  149  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0182985  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1272  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 
149 aa  148  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00612779  hitchhiker  0.000000016525 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0048  ATP-cone domain protein  51.7 
 
 
158 aa  149  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 
149 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 
149 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 
149 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 
149 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0042  ATP-cone domain protein  50.34 
 
 
165 aa  147  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.67036  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1143  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 
149 aa  147  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.086063  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  53.06 
 
 
172 aa  147  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 
149 aa  147  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>