83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0662 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0662  putative rRNA methylase  100 
 
 		 195 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2770  putative rRNA methylase  67.02 
 
 		 191 aa  281  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00973946  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3423  putative rRNA methylase  62.11 
 
 		 190 aa  252  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5002  hypothetical protein  61.05 
 
 		 190 aa  250  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.687939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4647  hypothetical protein  61.05 
 
 		 190 aa  250  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4862  hypothetical protein  61.05 
 
 		 190 aa  249  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4886  hypothetical protein  61.05 
 
 		 190 aa  249  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4482  SAM-dependent methyltransferase  61.05 
 
 		 190 aa  249  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4500  SAM-dependent methyltransferase  60.53 
 
 		 190 aa  249  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0375  hypothetical protein  60.53 
 
 		 190 aa  247  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4872  hypothetical protein  60.53 
 
 		 190 aa  246  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4893  hypothetical protein  60 
 
 		 190 aa  245  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4580  putative rRNA methylase  60 
 
 		 190 aa  245  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1321  hypothetical protein  45.26 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1851  hypothetical protein  47.62 
 
 		 187 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1816  hypothetical protein  47.62 
 
 		 187 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.185209  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  44.33 
 
 		 190 aa  167  8e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  43.33 
 
 		 187 aa  160  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  52.82 
 
 		 194 aa  154  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  40.35 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  40.44 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  39.89 
 
 		 209 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  37.04 
 
 		 188 aa  143  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  40.43 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  41.08 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  40.98 
 
 		 195 aa  141  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  40.43 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  40.43 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  40.34 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  39.68 
 
 		 189 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  40.56 
 
 		 1128 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  38.22 
 
 		 193 aa  134  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2114  putative rRNA methylase  46.11 
 
 		 243 aa  134  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  38.42 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  37.64 
 
 		 185 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000102664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3179  putative rRNA methylase  37.16 
 
 		 200 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  36.45 
 
 		 232 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0960  putative rRNA methylase  41.14 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  30.99 
 
 		 211 aa  118  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  40.26 
 
 		 196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  31.46 
 
 		 183 aa  110  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1337  hypothetical protein  31.46 
 
 		 183 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339513  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  39.71 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  32.07 
 
 		 194 aa  101  9e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0213  putative rRNA methylase  32.94 
 
 		 181 aa  99.4  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0073  putative rRNA methylase  38.69 
 
 		 225 aa  95.9  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0633  SAM-dependent methyltransferase  27.59 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42440  predicted protein  30.52 
 
 		 475 aa  53.9  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727315  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4992  S-adenosyl-methyltransferase MraW  34.69 
 
 		 313 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  46.81 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57450  S-adenosyl-methyltransferase MraW  34.69 
 
 		 313 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  32.65 
 
 		 315 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216905  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4520  S-adenosyl-methyltransferase MraW  32.65 
 
 		 315 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1329  S-adenosyl-methyltransferase MraW  32.65 
 
 		 315 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.98 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  27.2 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0181  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  37.33 
 
 		 262 aa  45.4  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.780552  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1012  S-adenosyl-methyltransferase MraW  36.59 
 
 		 310 aa  45.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 280 aa  45.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1668  S-adenosyl-methyltransferase MraW  32.93 
 
 		 316 aa  45.1  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0285  S-adenosyl-methyltransferase MraW  32.93 
 
 		 315 aa  45.1  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0179  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  37.33 
 
 		 262 aa  45.1  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.160214  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 263 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.21 
 
 		 253 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0914  S-adenosyl-methyltransferase MraW  34.34 
 
 		 314 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  29.5 
 
 		 585 aa  43.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  30.16 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0936  S-adenosyl-methyltransferase MraW  31.63 
 
 		 315 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13170  S-adenosyl-methyltransferase MraW  30.61 
 
 		 313 aa  42.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.916249  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3463  S-adenosyl-methyltransferase MraW  34.09 
 
 		 319 aa  42.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 278 aa  42.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 191 aa  42  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  32.5 
 
 		 269 aa  42  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1884  S-adenosyl-methyltransferase MraW  35.37 
 
 		 310 aa  42  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  20.88 
 
 		 392 aa  41.6  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.4 
 
 		 277 aa  41.6  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4110  S-adenosyl-methyltransferase MraW  31.46 
 
 		 313 aa  41.6  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0936286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1046  S-adenosyl-methyltransferase MraW  31.03 
 
 		 311 aa  41.6  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04771  putative methyltransferase  28.35 
 
 		 264 aa  41.6  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0935  S-adenosyl-methyltransferase MraW  32.93 
 
 		 298 aa  41.2  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 199 aa  41.2  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  25.53 
 
 		 221 aa  41.2  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>