132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0625 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  100 
 
 
413 aa  850    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  52.04 
 
 
413 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  43.94 
 
 
417 aa  361  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  42.09 
 
 
409 aa  333  5e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  43.07 
 
 
436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  36.87 
 
 
415 aa  250  4e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  27.73 
 
 
417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  32.63 
 
 
440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  29.92 
 
 
444 aa  157  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  30.5 
 
 
414 aa  152  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  30.24 
 
 
414 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2959  phage portal protein, HK97 family  28.86 
 
 
415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  28.34 
 
 
420 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  28.61 
 
 
421 aa  145  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  26.55 
 
 
413 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  26.55 
 
 
413 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  27.29 
 
 
434 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1060  HK97 family phage portal protein  29.65 
 
 
412 aa  136  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1080  HK97 family phage portal protein  29.65 
 
 
412 aa  136  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  26.55 
 
 
413 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  25.82 
 
 
544 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  27.47 
 
 
419 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  25.35 
 
 
408 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  28.08 
 
 
434 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  25.74 
 
 
407 aa  121  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  26.18 
 
 
424 aa  119  9e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  26.2 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  25.53 
 
 
524 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  25.96 
 
 
409 aa  117  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  24.57 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  23.31 
 
 
425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  23.31 
 
 
425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  23.31 
 
 
425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3805  hypothetical protein  26.59 
 
 
404 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4384  phage portal protein, HK97 family  31.2 
 
 
264 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4093  hypothetical protein  26.59 
 
 
389 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  24.93 
 
 
432 aa  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  24.59 
 
 
434 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  25.21 
 
 
423 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2238  phage portal protein, HK97 family  26.34 
 
 
389 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0330088  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  23.35 
 
 
407 aa  107  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  26.25 
 
 
422 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  23.28 
 
 
416 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  24.7 
 
 
389 aa  104  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  24.78 
 
 
412 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  24.02 
 
 
426 aa  103  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  22.28 
 
 
431 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2688  phage portal protein, HK97 family  25.19 
 
 
464 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.912505  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  24.86 
 
 
404 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  22.28 
 
 
444 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  23.87 
 
 
428 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  23.78 
 
 
441 aa  99  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  21.9 
 
 
420 aa  99.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  23.64 
 
 
436 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  23.64 
 
 
436 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  25.34 
 
 
455 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  25.37 
 
 
408 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  25.47 
 
 
416 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  25.47 
 
 
416 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  23.61 
 
 
411 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  25.87 
 
 
433 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  21.17 
 
 
416 aa  94.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  23.04 
 
 
401 aa  93.2  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  18.58 
 
 
408 aa  92.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  22.52 
 
 
417 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  24.06 
 
 
454 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  22.54 
 
 
460 aa  92  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  24.06 
 
 
454 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  25.4 
 
 
429 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  26.71 
 
 
404 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  22.07 
 
 
395 aa  91.3  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  22.48 
 
 
429 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  22.99 
 
 
445 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  22.22 
 
 
542 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  21.3 
 
 
428 aa  89  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  22.42 
 
 
435 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  23.24 
 
 
473 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  23.08 
 
 
447 aa  82  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  22.69 
 
 
408 aa  80.1  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  24.6 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  22.4 
 
 
445 aa  79.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  22.4 
 
 
445 aa  79.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  20.81 
 
 
455 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  20.21 
 
 
420 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  20.56 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  22.62 
 
 
833 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  22.5 
 
 
859 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  22.62 
 
 
833 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  20.39 
 
 
457 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1772  HK97 family phage portal protein  22.73 
 
 
451 aa  77  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  27.66 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  27.66 
 
 
392 aa  76.3  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  21.78 
 
 
448 aa  75.5  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  22.55 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  20.63 
 
 
393 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  21.99 
 
 
434 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  22.1 
 
 
437 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  19.72 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  24.38 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2901  HK97 family phage portal protein  22.63 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149993  normal  0.456883 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>