81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0621 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  100 
 
 
135 aa  283  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  58.4 
 
 
127 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  53.97 
 
 
125 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4388  HNH endonuclease  52.38 
 
 
105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  37.5 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1077  HNH endonuclease  48.15 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.687117  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1057  HNH endonuclease  48.15 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4096  prophage LambdaBa02, HNH endonuclease family protein  47.87 
 
 
120 aa  83.6  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3808  prophage LambdaBa02, HNH endonuclease family protein  47.87 
 
 
120 aa  83.6  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  37.5 
 
 
119 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  36.51 
 
 
118 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  35.16 
 
 
119 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  34.38 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  36.72 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1121  HNH endonuclease  36.75 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  40.22 
 
 
116 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  34.11 
 
 
118 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  40.4 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  33.83 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  37.21 
 
 
116 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  32.85 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  34.75 
 
 
115 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  36.04 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  39.51 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  34.68 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  36.59 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  39.17 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  35.66 
 
 
116 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2604  HNH endonuclease  34.92 
 
 
116 aa  61.6  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0017  HNH endonuclease domain protein  35 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2062  HNH endonuclease  40.24 
 
 
99 aa  60.8  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0218324  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2025  HNH endonuclease  40.24 
 
 
99 aa  60.8  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3975  HNH endonuclease  34.75 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1748  HNH endonuclease  41.18 
 
 
138 aa  60.5  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  41.33 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  41.33 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1652  restriction endonuclease  29.79 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  49.15 
 
 
106 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0545  gp82  35.29 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.719132  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1453  hypothetical protein  29.57 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  46.97 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3594  HNH endonuclease  34.12 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1967  hypothetical protein  35.37 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2617  hypothetical protein  36.46 
 
 
120 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4278  hypothetical protein  36.46 
 
 
120 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  40.51 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1561  phage holin, putative  33.33 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250556  hitchhiker  0.000211382 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0656  gp65  35.29 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  40.58 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2705  gp65  34.88 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.271328  normal  0.759343 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1374  gp65  30.77 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0798155 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  30.15 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1333  HNH endonuclease  33.33 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.212728 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2634  HNH endonuclease  34.72 
 
 
110 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.017055  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0235  hypothetical protein  34.48 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  37.68 
 
 
112 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2291  HNH endonuclease  35.71 
 
 
89 aa  47  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08210  HNH endonuclease  36.14 
 
 
97 aa  47  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00377503  hitchhiker  0.00349678 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1331  HNH endonuclease  35.71 
 
 
89 aa  47  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  45 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  45 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0212  HNH nuclease  36.62 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307481  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  32.43 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1716  HNH endonuclease  34.94 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1122  HNH endonuclease  42.62 
 
 
228 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0873  HNH endonuclease  33.33 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.473329  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  34.21 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  43.1 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0461  prophage lambdaba04, gp54  31.76 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  40.28 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  33.82 
 
 
299 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0440  prophage LambdaBa04, Gp54  31.76 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.8645  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8234  HNH endonuclease  36.71 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0543214  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1548  hypothetical protein  46.67 
 
 
128 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  37.14 
 
 
129 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  32.43 
 
 
587 aa  41.2  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1339  hypothetical protein  32.1 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891633  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3512  phage-like protein  30.49 
 
 
98 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.88204  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  37.84 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0279  HNH endonuclease  27.61 
 
 
119 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3433  HNH endonuclease  30.49 
 
 
98 aa  40  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>