30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0604 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0604  recombination and repair protein RecT  100 
 
 		 281 aa  585  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2617  recombination and repair protein RecT  65.84 
 
 		 268 aa  374  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000206281  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1472  recombination and repair protein RecT  49.63 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.515262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2295  RecT protein  53.25 
 
 		 269 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133363  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01336  hypothetical protein  53.25 
 
 		 269 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01326  recombination and repair protein  53.25 
 
 		 269 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1382  recombination and repair protein RecT  52.81 
 
 		 276 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000254024 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1851  RecT protein  45.58 
 
 		 349 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0204847  decreased coverage  0.000000000311645 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7123  RecT protein  40.73 
 
 		 351 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0610415  hitchhiker  0.000150871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2507  RecT protein  40.1 
 
 		 318 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2699  rect protein  38.18 
 
 		 294 aa  139  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497074  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5094  RecT protein  43.41 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.713826  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4075  RecT protein  42.11 
 
 		 312 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1916  RecT protein  32.58 
 
 		 307 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.427469  hitchhiker  0.0000000000811142 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1419  phage recombinase  32.39 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000444725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3047  RecT protein  30.09 
 
 		 313 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00571481  normal  0.0332137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4008  RecT protein  27.55 
 
 		 299 aa  86.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0283  RecT family protein  34.76 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4070  RecT protein  32.76 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0866384  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0939  RecT family protein  28.35 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1674  recombinational DNA repair protein (RecE pathway)  26.19 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1003  RecT protein  30.7 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  hitchhiker  0.0000388428 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0811  RecT protein  24.88 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.481078  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2078  RecT protein  30.99 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0329  RecT protein  30.99 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2041  RecT protein  30.99 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0320  RecT protein  30.99 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1139  RecT protein  27.38 
 
 		 329 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0977  hypothetical protein  25.74 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.275626  hitchhiker  0.000000000886985 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4180  hypothetical protein  25 
 
 		 215 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.171725  normal  0.246945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>