More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0571 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  72.69 
 
 
492 aa  744    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  100 
 
 
490 aa  1001    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  56.11 
 
 
481 aa  550  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  55.9 
 
 
482 aa  547  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  55.69 
 
 
482 aa  547  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  55.69 
 
 
482 aa  547  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  55.69 
 
 
481 aa  547  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  55.9 
 
 
482 aa  546  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  55.49 
 
 
482 aa  544  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  55.28 
 
 
481 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  55.28 
 
 
482 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  55.07 
 
 
481 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  56.24 
 
 
481 aa  530  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  50.62 
 
 
486 aa  439  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.89 
 
 
500 aa  395  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  44.42 
 
 
510 aa  378  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  42.47 
 
 
479 aa  371  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  42.17 
 
 
473 aa  354  2e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0280  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  40.21 
 
 
484 aa  343  5e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  38.18 
 
 
499 aa  328  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 
508 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.58 
 
 
491 aa  301  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  38.87 
 
 
508 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 
508 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.88 
 
 
498 aa  292  8e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  37.27 
 
 
503 aa  292  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  34.62 
 
 
496 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0770  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  38.4 
 
 
451 aa  288  1e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  37.99 
 
 
501 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.38 
 
 
529 aa  286  5.999999999999999e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  34.42 
 
 
496 aa  286  8e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0023  O-succinylbenzoate-CoA ligase  39.8 
 
 
494 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692894  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  34.95 
 
 
496 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  34.95 
 
 
496 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.9 
 
 
517 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.9 
 
 
517 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.9 
 
 
517 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.43 
 
 
528 aa  279  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 
518 aa  278  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  37.02 
 
 
516 aa  277  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  38.57 
 
 
520 aa  276  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  36.75 
 
 
509 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1883  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.93 
 
 
492 aa  273  5.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1847  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.93 
 
 
492 aa  273  5.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.05 
 
 
514 aa  273  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 
505 aa  272  9e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  36.82 
 
 
1043 aa  267  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.1 
 
 
474 aa  265  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  37.85 
 
 
620 aa  265  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  35.03 
 
 
503 aa  262  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  35.8 
 
 
508 aa  261  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.26 
 
 
453 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  38.59 
 
 
551 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  35.01 
 
 
504 aa  261  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0047  AMP-dependent synthetase and ligase  35.49 
 
 
517 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 
530 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.17 
 
 
524 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 
515 aa  257  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  34.97 
 
 
521 aa  256  5e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 
516 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 
520 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  36.18 
 
 
490 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 
511 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 
531 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3566  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 
489 aa  253  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.281044  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3129  AMP-dependent synthetase and ligase  35.04 
 
 
534 aa  253  6e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  37.16 
 
 
500 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.56 
 
 
513 aa  251  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 
506 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  37.67 
 
 
553 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 
512 aa  249  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  34.9 
 
 
512 aa  249  8e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.98 
 
 
512 aa  249  8e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 
487 aa  249  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 
518 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.19 
 
 
519 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 
518 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.56 
 
 
530 aa  247  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  34.19 
 
 
513 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  34.97 
 
 
534 aa  246  4.9999999999999997e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5271  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 
541 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  33.94 
 
 
503 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  31.8 
 
 
534 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.097494  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  32.34 
 
 
500 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 
515 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 
512 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 
518 aa  244  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 
493 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 
552 aa  244  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.99 
 
 
570 aa  243  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  37.98 
 
 
585 aa  243  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  31.76 
 
 
500 aa  243  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.85 
 
 
527 aa  243  7.999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  35.38 
 
 
526 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5453  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 
554 aa  242  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1497  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 
690 aa  242  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.5 
 
 
556 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  32.15 
 
 
500 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.5 
 
 
556 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.5 
 
 
556 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>