More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0567 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  100 
 
 
461 aa  937    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  57.52 
 
 
460 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  42.02 
 
 
464 aa  340  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  42.02 
 
 
464 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  41.12 
 
 
464 aa  326  6e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  40.09 
 
 
464 aa  326  6e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  41.12 
 
 
464 aa  326  6e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.87 
 
 
464 aa  324  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.87 
 
 
464 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.66 
 
 
464 aa  323  6e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.66 
 
 
464 aa  323  6e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.87 
 
 
464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  40.67 
 
 
464 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  40.81 
 
 
482 aa  288  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  39.35 
 
 
469 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  38.12 
 
 
467 aa  253  6e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.85 
 
 
476 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.85 
 
 
476 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.24 
 
 
481 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  38.9 
 
 
455 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.74 
 
 
477 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  41.01 
 
 
476 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  38.39 
 
 
554 aa  241  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.39 
 
 
476 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  37.16 
 
 
486 aa  234  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  36.63 
 
 
409 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.68 
 
 
484 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  37.69 
 
 
445 aa  230  4e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.68 
 
 
492 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.68 
 
 
484 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  37.41 
 
 
451 aa  230  5e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.71 
 
 
481 aa  229  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  35.33 
 
 
453 aa  224  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  35.33 
 
 
453 aa  224  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  35.85 
 
 
456 aa  219  7e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  35.08 
 
 
452 aa  219  7.999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  37.13 
 
 
483 aa  217  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  37.29 
 
 
451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  32.68 
 
 
415 aa  210  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  37.01 
 
 
412 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  36.13 
 
 
495 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  28.54 
 
 
492 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  30.54 
 
 
498 aa  198  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  28.54 
 
 
492 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  41.48 
 
 
428 aa  196  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  36.88 
 
 
402 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  29.98 
 
 
471 aa  194  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  39.29 
 
 
384 aa  192  9e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  34.15 
 
 
466 aa  192  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2977  isochorismate synthase  30.72 
 
 
490 aa  191  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  30.75 
 
 
473 aa  190  5.999999999999999e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  32.76 
 
 
391 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  40.07 
 
 
425 aa  188  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  39.38 
 
 
465 aa  188  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  32.76 
 
 
391 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  29.42 
 
 
473 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.05 
 
 
471 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  39.85 
 
 
391 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  39.85 
 
 
391 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  39.85 
 
 
391 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  38.81 
 
 
506 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  37.59 
 
 
391 aa  186  9e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  34.48 
 
 
407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  28.23 
 
 
465 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  40.65 
 
 
391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.822234 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  40.24 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  38.72 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  38.72 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  38.72 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  38.72 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  38.72 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  40.24 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  38.72 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  40.24 
 
 
391 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  37.54 
 
 
449 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  35.11 
 
 
451 aa  183  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  39.63 
 
 
395 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  30.43 
 
 
471 aa  183  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  29.06 
 
 
468 aa  183  7e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  36.97 
 
 
395 aa  183  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  33.84 
 
 
413 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  34.76 
 
 
485 aa  180  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  43.12 
 
 
401 aa  180  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1126  isochorismate synthases  33.1 
 
 
471 aa  179  7e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0774  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.26 
 
 
379 aa  179  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  32.68 
 
 
469 aa  177  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  38.41 
 
 
425 aa  176  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  36.24 
 
 
473 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  37.07 
 
 
424 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  34.05 
 
 
441 aa  173  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  30.84 
 
 
452 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14050  isochorismate synthase family protein  29.93 
 
 
418 aa  172  7.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  38.18 
 
 
390 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  40.07 
 
 
484 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  29.2 
 
 
475 aa  172  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24140  isochorismate synthase family protein  36.62 
 
 
435 aa  171  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.98 
 
 
440 aa  171  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  41.18 
 
 
394 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02521  isochorismate synthase  32.08 
 
 
466 aa  169  8e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  37.82 
 
 
447 aa  169  9e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>