More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0511 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  74.14 
 
 
912 aa  1231  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 
901 aa  1842  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1272  1A family penicillin-binding protein  45.78 
 
 
865 aa  621  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.932198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  43.62 
 
 
914 aa  600  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  47.87 
 
 
839 aa  600  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  49.02 
 
 
836 aa  601  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1458  penicillin-binding protein  43.98 
 
 
896 aa  595  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.126444  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1643  penicillin-binding protein  43.98 
 
 
897 aa  595  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00351839 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  47.72 
 
 
834 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1430  penicillin-binding protein  43.98 
 
 
897 aa  595  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  47.72 
 
 
834 aa  593  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  47.8 
 
 
837 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1431  penicillin-binding protein  43.86 
 
 
897 aa  595  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  47.72 
 
 
835 aa  594  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1716  penicillin-binding protein  43.23 
 
 
900 aa  594  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1572  penicillin-binding protein  43.98 
 
 
897 aa  595  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  47.95 
 
 
830 aa  592  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1678  penicillin-binding protein  43.23 
 
 
905 aa  595  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  47.8 
 
 
832 aa  594  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  47.5 
 
 
837 aa  590  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1605  penicillin-binding protein  44.17 
 
 
897 aa  590  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  47.42 
 
 
820 aa  589  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  47.42 
 
 
846 aa  589  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  46.49 
 
 
794 aa  569  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3739  penicillin-binding protein  48.32 
 
 
647 aa  562  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1538  glycosyl transferase family protein  40.47 
 
 
727 aa  457  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1509  glycosyl transferase family protein  40.47 
 
 
727 aa  457  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1025  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  41.1 
 
 
791 aa  454  1e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1020  penicillin-binding protein 2  39.78 
 
 
743 aa  452  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0920  1A family penicillin-binding protein  38.88 
 
 
754 aa  443  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  37.75 
 
 
765 aa  442  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0277  penicillin-binding protein 1A  37.37 
 
 
773 aa  418  1e-115  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0298  penicillin-binding protein 1A  38.25 
 
 
750 aa  405  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.376505  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0542  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  39.81 
 
 
623 aa  403  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.158296  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0651  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  37.91 
 
 
730 aa  402  1e-110  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.188168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  34.94 
 
 
795 aa  396  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  4.6818e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  34.08 
 
 
828 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  37.46 
 
 
761 aa  393  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  35.4 
 
 
880 aa  392  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  37.56 
 
 
727 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1095  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  37.35 
 
 
879 aa  377  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  36.83 
 
 
905 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  40.37 
 
 
709 aa  376  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  34.63 
 
 
814 aa  362  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  34.74 
 
 
727 aa  357  4e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  36.03 
 
 
829 aa  341  4e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  34.78 
 
 
706 aa  337  8e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  34.43 
 
 
806 aa  333  9e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  34.06 
 
 
843 aa  332  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  36.36 
 
 
721 aa  331  5e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  34.99 
 
 
824 aa  329  1e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  33.81 
 
 
705 aa  328  2e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  33.13 
 
 
705 aa  328  2e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  33.15 
 
 
941 aa  328  2e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  34.43 
 
 
680 aa  328  2e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  33.81 
 
 
705 aa  328  4e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  33.81 
 
 
705 aa  328  4e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  33.81 
 
 
705 aa  328  4e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  33.65 
 
 
705 aa  327  8e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  34.6 
 
 
667 aa  326  9e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.44476e-08 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  33.49 
 
 
705 aa  326  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  34.26 
 
 
679 aa  325  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  33.55 
 
 
680 aa  324  5e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  35.96 
 
 
680 aa  323  6e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.66869e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  34.85 
 
 
746 aa  324  6e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  35.78 
 
 
680 aa  323  9e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  34.43 
 
 
680 aa  323  1e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  6.91863e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  35.04 
 
 
679 aa  323  1e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  34.1 
 
 
673 aa  321  4e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  34.1 
 
 
673 aa  321  4e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  3.33103e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0260  penicillin-binding protein 2A  35.97 
 
 
775 aa  320  5e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.882065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  35.07 
 
 
680 aa  319  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  1.38665e-10 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  32.61 
 
 
705 aa  314  4e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  33.02 
 
 
705 aa  314  5e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  32.72 
 
 
746 aa  312  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  35.59 
 
 
643 aa  312  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2066  penicillin-binding protein 2A  34.85 
 
 
773 aa  308  3e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  35.2 
 
 
649 aa  306  9e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  36.56 
 
 
761 aa  305  3e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  35.2 
 
 
643 aa  303  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  35.2 
 
 
643 aa  303  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  34.97 
 
 
618 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  33.55 
 
 
708 aa  297  7e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1452  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.02 
 
 
685 aa  297  7e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  33.13 
 
 
661 aa  297  7e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  34.56 
 
 
648 aa  296  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  36.4 
 
 
734 aa  296  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  33.81 
 
 
728 aa  294  6e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1213  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.22 
 
 
686 aa  294  6e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  34.09 
 
 
654 aa  294  6e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0346  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.7 
 
 
863 aa  294  6e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0900  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.75 
 
 
687 aa  293  1e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.813992  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  32.11 
 
 
728 aa  291  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2410  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.71 
 
 
743 aa  291  4e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  33.69 
 
 
681 aa  291  5e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  33.75 
 
 
727 aa  290  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  34.77 
 
 
727 aa  290  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2876  glycosyl transferase family 51  32.36 
 
 
861 aa  289  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.186058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  32.94 
 
 
683 aa  289  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  35.45 
 
 
732 aa  287  8e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>