More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0402 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0402  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 241 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  87.82 
 
 		 240 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  81.01 
 
 		 238 aa  395  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  80.59 
 
 		 238 aa  388  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  79.75 
 
 		 250 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  79.75 
 
 		 238 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  80.17 
 
 		 238 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  79.75 
 
 		 238 aa  386  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  79.75 
 
 		 238 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  79.75 
 
 		 250 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  79.75 
 
 		 238 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  79.75 
 
 		 250 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  80.17 
 
 		 238 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  71.05 
 
 		 241 aa  341  5.999999999999999e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  71.05 
 
 		 241 aa  341  5.999999999999999e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  71 
 
 		 241 aa  340  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.22 
 
 		 233 aa  314  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.17 
 
 		 230 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.58 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  53.68 
 
 		 230 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  54.11 
 
 		 256 aa  249  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  55.7 
 
 		 227 aa  249  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  51.3 
 
 		 229 aa  237  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3085  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.31 
 
 		 232 aa  228  7e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000315463  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4198  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.36 
 
 		 226 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 238 aa  223  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  47.83 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 		 223 aa  222  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 		 223 aa  221  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  49.34 
 
 		 223 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  49.34 
 
 		 223 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  49.34 
 
 		 223 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  49.34 
 
 		 223 aa  219  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  49.34 
 
 		 223 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 225 aa  218  6e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 		 237 aa  218  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  49.57 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.39 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  49.13 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.15 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 		 223 aa  215  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.05 
 
 		 228 aa  215  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  49.35 
 
 		 229 aa  214  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.5 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.15 
 
 		 240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  46.58 
 
 		 231 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  47.6 
 
 		 223 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  47.19 
 
 		 237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 		 227 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  47.19 
 
 		 237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  49.57 
 
 		 236 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  47.19 
 
 		 237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  45.8 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  47.19 
 
 		 237 aa  211  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  47.86 
 
 		 232 aa  211  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  48.48 
 
 		 237 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  46.61 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  45.89 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.28 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  47.19 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 		 232 aa  209  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  48.47 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.32 
 
 		 235 aa  208  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.5 
 
 		 230 aa  207  8e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.57 
 
 		 226 aa  208  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  47.16 
 
 		 232 aa  207  8e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.26 
 
 		 230 aa  207  8e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  45.76 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.29 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.69 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.84 
 
 		 227 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  49.57 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1261  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000139979  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  48.05 
 
 		 239 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  48.05 
 
 		 239 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  48.05 
 
 		 239 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  48.05 
 
 		 239 aa  206  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  48.05 
 
 		 239 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  48.05 
 
 		 239 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 235 aa  205  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.41 
 
 		 230 aa  205  7e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  47.62 
 
 		 239 aa  204  8e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  48.67 
 
 		 235 aa  204  8e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  48.67 
 
 		 235 aa  204  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  48.67 
 
 		 235 aa  204  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  48.67 
 
 		 235 aa  204  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  48.67 
 
 		 235 aa  204  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  48.67 
 
 		 235 aa  204  8e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  48.67 
 
 		 235 aa  204  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0246  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.3 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0272164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  48.09 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  48.67 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  48.67 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.92 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.4 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  48.09 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>