More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0362 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  100 
 
 
186 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  77.05 
 
 
186 aa  301  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  59.09 
 
 
179 aa  223  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  59.09 
 
 
179 aa  223  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  59.09 
 
 
179 aa  222  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  59.09 
 
 
179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  59.09 
 
 
179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  59.09 
 
 
179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  59.09 
 
 
179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  59.09 
 
 
179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  59.09 
 
 
179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  58.52 
 
 
179 aa  219  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  58.52 
 
 
179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  51.93 
 
 
179 aa  180  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  50.28 
 
 
180 aa  175  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  50.28 
 
 
180 aa  175  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  45.25 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  47.98 
 
 
184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  47.95 
 
 
179 aa  164  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  47.7 
 
 
180 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  46.11 
 
 
176 aa  164  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 
182 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  48.5 
 
 
178 aa  158  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 
177 aa  158  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  47.46 
 
 
180 aa  157  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 
190 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  46.86 
 
 
194 aa  154  6e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  47.19 
 
 
176 aa  153  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 
281 aa  151  4e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0604  MutT/nudix family protein  52.51 
 
 
182 aa  151  7e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 
175 aa  150  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
184 aa  149  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1537  MutT/nudix family protein  51.67 
 
 
184 aa  149  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.652785  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
177 aa  149  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  43.53 
 
 
178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  46.41 
 
 
177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  43.5 
 
 
183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  43.02 
 
 
180 aa  145  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  46.78 
 
 
179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  43.35 
 
 
176 aa  142  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  40.57 
 
 
185 aa  141  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  42.77 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 
199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  41.62 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  43.37 
 
 
184 aa  139  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  39.04 
 
 
187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 
175 aa  136  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  42.35 
 
 
169 aa  136  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  41.28 
 
 
171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  41.04 
 
 
176 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 
183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  40 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  43.29 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  41.38 
 
 
185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
199 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 
189 aa  128  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 
199 aa  127  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  39.41 
 
 
179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 
180 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 
204 aa  124  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
182 aa  124  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  36.16 
 
 
208 aa  124  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  41.52 
 
 
171 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  39.31 
 
 
196 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  40.65 
 
 
184 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 
184 aa  123  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  39.31 
 
 
196 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  39.41 
 
 
183 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  38.15 
 
 
204 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  39.31 
 
 
196 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  39.31 
 
 
196 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  38.73 
 
 
194 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 
194 aa  121  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
173 aa  121  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 
183 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.15 
 
 
196 aa  121  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
196 aa  121  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.15 
 
 
196 aa  121  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  41.57 
 
 
173 aa  121  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  38.15 
 
 
196 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  38.15 
 
 
196 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.15 
 
 
196 aa  121  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.15 
 
 
196 aa  121  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.15 
 
 
196 aa  121  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  38.95 
 
 
196 aa  121  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  38.95 
 
 
196 aa  121  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  40.88 
 
 
172 aa  120  9e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  41.77 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  38.98 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.57 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
187 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 
211 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
178 aa  119  3.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  41.24 
 
 
173 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  37.64 
 
 
181 aa  117  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>