More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0342 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
334 aa  681  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0313  sensor histidine kinase  36.2 
 
 
346 aa  230  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0698  ATPase domain-containing protein  36.5 
 
 
346 aa  225  8e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.541747  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 
346 aa  225  8e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.132473  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2323  histidine kinase  32.2 
 
 
328 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0514446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4977  sensor histidine kinase  31.25 
 
 
340 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5088  sensor histidine kinase  31.25 
 
 
340 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4949  sensor histidine kinase  31.25 
 
 
340 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4568  sensor histidine kinase  31.25 
 
 
340 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00420124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4990  sensor histidine kinase  31.25 
 
 
340 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4726  sensor histidine kinase  31.25 
 
 
340 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0271  sensor histidine kinase  31.25 
 
 
340 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4962  sensor histidine kinase  31.25 
 
 
340 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4588  sensor histidine kinase  30.94 
 
 
340 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.868097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
340 aa  149  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4678  histidine kinase  31.25 
 
 
340 aa  148  1e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2539  histidine kinase  31.15 
 
 
327 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4571  sensor histidine kinase  30.86 
 
 
360 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5199  sensor histidine kinase  33.14 
 
 
341 aa  140  2e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0678  sensor histidine kinase  31.96 
 
 
353 aa  141  2e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238999  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1309  sensor histidine kinase  32.53 
 
 
323 aa  140  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000599634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2656  sensor protein YxdK  29.91 
 
 
327 aa  140  4e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.15985e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4172  two-component sensor histidine kinase  30.57 
 
 
370 aa  139  9e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.420668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1527  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
343 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2618  sensor histidine kinase, putative  29.28 
 
 
334 aa  137  3e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0136174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4530  sensor histidine kinase  30.29 
 
 
370 aa  136  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2344  sensor histidine kinase  29.6 
 
 
334 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00230354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4183  sensor histidine kinase  30.29 
 
 
370 aa  136  6e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2379  two-component sensor histidine kinase  29.91 
 
 
334 aa  135  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00984637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3153  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
360 aa  135  1e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4284  histidine kinase  27.67 
 
 
360 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.895654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2615  sensor histidine kinase  29.6 
 
 
327 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.46507e-09 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4518  sensor histidine kinase  31.49 
 
 
353 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2305  histidine kinase  28.12 
 
 
328 aa  133  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000217968  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03370  signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
347 aa  132  6e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4556  sensor histidine kinase  31.65 
 
 
353 aa  131  1e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 
341 aa  127  2e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0116  sensor histidine kinase  28.23 
 
 
337 aa  128  2e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0322042  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0118  sensor histidine kinase  27.89 
 
 
337 aa  127  4e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.151918  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0494  histidine kinase  28.04 
 
 
340 aa  125  8e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.752547  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4335  histidine kinase-like ATPase  30.56 
 
 
321 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2571  sensor protein YxdK  30.25 
 
 
276 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.86964  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2176  histidine kinase  29.03 
 
 
368 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
350 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1092  histidine kinase  30.38 
 
 
303 aa  124  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2753  sensor histidine kinase  29.54 
 
 
279 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.30626e-07 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0522  histidine kinase  29.63 
 
 
331 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0837  sensor histidine kinase  32.79 
 
 
336 aa  119  1e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0398077  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0831  sensor histidine kinase  33.88 
 
 
336 aa  115  8e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0938177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2421  sensor histidine kinase, C-terminal  33.19 
 
 
252 aa  114  2e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208231  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1081  histidine kinase  27.65 
 
 
346 aa  113  4e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.837913 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0977  sensor histidine kinase  26.77 
 
 
312 aa  113  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1909  Signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
291 aa  112  7e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2205  sensor histidine kinase, putative  31.43 
 
 
301 aa  112  7e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1416  histidine kinase  26.05 
 
 
342 aa  112  1e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122743  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0835  Signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
331 aa  110  4e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0874026  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
326 aa  108  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.841389  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2647  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
295 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2703  ATPase domain-containing protein  31.31 
 
 
295 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1757  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
614 aa  97.1  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
444 aa  96.3  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0656  sensor histidine kinase, putative  29.3 
 
 
357 aa  95.9  8e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0734197  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0804  histidine kinase  30.14 
 
 
322 aa  95.1  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0156746  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  30.4 
 
 
257 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
637 aa  93.6  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.3 
 
 
639 aa  92.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 
639 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0881  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
453 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.236572 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 
467 aa  90.1  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
592 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130733  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
592 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233259  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
487 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  8.76727e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  29.44 
 
 
565 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2581  histidine kinase  25.75 
 
 
471 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0578515  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
592 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  27.43 
 
 
598 aa  87.4  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0941  histidine kinase  29.1 
 
 
540 aa  87  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.036916  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
585 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2285  histidine kinase  29.78 
 
 
510 aa  86.7  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.43872e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 
589 aa  86.3  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  25.99 
 
 
364 aa  85.1  1e-15  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3784  histidine kinase  28.27 
 
 
496 aa  85.1  1e-15  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  25.99 
 
 
364 aa  84.7  2e-15  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
785 aa  84  3e-15  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.11 
 
 
639 aa  83.6  4e-15  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 
466 aa  83.6  4e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.4 
 
 
641 aa  83.2  5e-15  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3952  histidine kinase  26.89 
 
 
747 aa  82.8  8e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
509 aa  82.4  9e-15  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0045  histidine kinase  27.43 
 
 
370 aa  82  1e-14  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3930  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 
342 aa  82  1e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0182336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  26.4 
 
 
1137 aa  82.4  1e-14  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.85 
 
 
1816 aa  82  1e-14  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  27.8 
 
 
352 aa  81.6  2e-14  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
350 aa  81.3  2e-14  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1930  histidine kinase  26.76 
 
 
476 aa  80.9  3e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.592963  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3846  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
352 aa  80.9  3e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1531  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.39 
 
 
643 aa  80.9  3e-14  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0726  histidine kinase  27.73 
 
 
570 aa  80.9  3e-14  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.408803  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2911  Signal transduction histidine kinase-like  27.27 
 
 
614 aa  80.9  3e-14  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.522468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>