More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0324 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0324  CheW protein  100 
 
 		 161 aa  315  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2282  CheW protein  59.6 
 
 		 160 aa  190  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0124299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  36.43 
 
 		 154 aa  100  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  33.56 
 
 		 159 aa  93.6  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  34.33 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  33.55 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  37.69 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  30.14 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  34.88 
 
 		 145 aa  84.3  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  33.54 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  34.18 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  33.54 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  34.25 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  30.26 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  29.46 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  33.09 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  32.56 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  33.57 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  34.59 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  31.29 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  31.03 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  33.33 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  28.68 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  30.94 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  28.68 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  33.08 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  33.57 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  33.57 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  32.41 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  32.09 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  33.33 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  31.16 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  32.37 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  28.15 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  29.77 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  28.26 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  29.58 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  33.6 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  29.77 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  32.41 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  37.68 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  25 
 
 		 478 aa  76.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  32.61 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  32.19 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  30.83 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  28.1 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  33.87 
 
 		 518 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  27.33 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  32.87 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  32.35 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  32.35 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  32.06 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.08 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  27.21 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  32.58 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  32.58 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  33.08 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  29.81 
 
 		 181 aa  73.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  34.04 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  30.23 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3125  CheW protein  31.88 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.29 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  32.33 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  35.77 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  30.43 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1681  putative CheW protein  35.77 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0157422  hitchhiker  0.0044315 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  30.41 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  30.5 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  28.89 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  29.93 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  28.46 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  30.71 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  31.62 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  28.28 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  28.99 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  29.71 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  30.99 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  26.36 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  33.64 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  30.15 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  33.82 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  28.93 
 
 		 179 aa  70.5  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1759  putative CheW protein  31.16 
 
 		 168 aa  70.5  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1667  putative CheW protein  39.09 
 
 		 141 aa  70.5  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.33191  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  27.97 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  32.58 
 
 		 533 aa  70.5  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  28.47 
 
 		 515 aa  70.1  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  26.92 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1963  CheW protein  31.16 
 
 		 168 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.187208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  30.66 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  29.37 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  32.65 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  28.57 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  29.71 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  29.37 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0258  CheW protein  28.68 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000534163  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  29.71 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  29.85 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  30.23 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  24.81 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>