More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0324 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0324  CheW protein  100 
 
 
161 aa  315  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2282  CheW protein  59.6 
 
 
160 aa  190  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0124299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  36.43 
 
 
154 aa  100  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  33.56 
 
 
159 aa  93.6  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  34.33 
 
 
158 aa  87  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  37.69 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  33.55 
 
 
162 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  30.14 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  34.88 
 
 
145 aa  84.3  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  33.54 
 
 
194 aa  83.2  1e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  34.18 
 
 
178 aa  83.6  1e-15  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  34.25 
 
 
157 aa  83.6  1e-15  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  33.54 
 
 
194 aa  83.2  1e-15  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  30.26 
 
 
162 aa  82.8  2e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  33.09 
 
 
159 aa  82  3e-15  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  29.46 
 
 
148 aa  82  3e-15  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  32.56 
 
 
183 aa  81.6  4e-15  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  33.57 
 
 
169 aa  81.3  5e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  34.59 
 
 
169 aa  80.1  1e-14  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  31.29 
 
 
218 aa  80.1  1e-14  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  28.68 
 
 
146 aa  79.3  2e-14  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  33.33 
 
 
166 aa  79.3  2e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  30.94 
 
 
167 aa  79  2e-14  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  28.68 
 
 
146 aa  79.3  2e-14  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  31.03 
 
 
167 aa  79.3  2e-14  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  33.57 
 
 
164 aa  79  3e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  32.41 
 
 
163 aa  79  3e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  33.08 
 
 
160 aa  79  3e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  33.57 
 
 
164 aa  79  3e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  31.16 
 
 
174 aa  77.8  6e-14  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  33.33 
 
 
194 aa  77.8  6e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  32.09 
 
 
163 aa  77.8  6e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  32.37 
 
 
168 aa  77.4  8e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  29.77 
 
 
152 aa  77  1e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  33.6 
 
 
161 aa  76.6  1e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  28.15 
 
 
170 aa  76.6  1e-13  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  29.77 
 
 
152 aa  77  1e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  29.58 
 
 
140 aa  76.6  1e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  28.26 
 
 
162 aa  76.6  1e-13  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  30.83 
 
 
167 aa  75.9  2e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  27.33 
 
 
180 aa  76.3  2e-13  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  32.19 
 
 
164 aa  76.3  2e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  1.23984e-08 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  37.68 
 
 
170 aa  76.3  2e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  28.1 
 
 
163 aa  75.9  2e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  32.41 
 
 
163 aa  76.3  2e-13  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  33.87 
 
 
518 aa  75.9  2e-13  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  32.61 
 
 
174 aa  75.9  2e-13  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  25 
 
 
478 aa  76.3  2e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  32.35 
 
 
165 aa  75.5  3e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  32.35 
 
 
165 aa  75.5  3e-13  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4863e-14 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  32.87 
 
 
154 aa  75.5  3e-13  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  32.06 
 
 
155 aa  74.7  4e-13  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  27.21 
 
 
146 aa  74.7  5e-13  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.08 
 
 
164 aa  74.7  5e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  32.58 
 
 
157 aa  74.3  6e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  32.58 
 
 
139 aa  74.3  6e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  33.08 
 
 
185 aa  74.3  6e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  29.81 
 
 
181 aa  73.9  9e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  34.04 
 
 
163 aa  73.6  1e-12  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  30.23 
 
 
166 aa  73.6  1e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3125  CheW protein  31.88 
 
 
169 aa  73.6  1e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  30.43 
 
 
159 aa  73.2  2e-12  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  32.33 
 
 
185 aa  72.4  2e-12  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  30.5 
 
 
159 aa  72.4  2e-12  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  28.89 
 
 
162 aa  72.8  2e-12  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  30.41 
 
 
160 aa  73.2  2e-12  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  35.77 
 
 
169 aa  72.4  2e-12  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1681  putative CheW protein  35.77 
 
 
169 aa  72.4  2e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0157422  hitchhiker  0.0044315 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.29 
 
 
164 aa  72.4  2e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  28.46 
 
 
158 aa  72  3e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  30.71 
 
 
167 aa  72  3e-12  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  29.93 
 
 
165 aa  72.4  3e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  31.62 
 
 
164 aa  72.4  3e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.45541e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  28.99 
 
 
163 aa  71.6  4e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  28.28 
 
 
169 aa  71.6  4e-12  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  26.36 
 
 
165 aa  71.2  5e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  30.99 
 
 
164 aa  71.6  5e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  29.71 
 
 
171 aa  71.2  5e-12  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  33.64 
 
 
159 aa  71.6  5e-12  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  30.15 
 
 
165 aa  70.9  7e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  33.82 
 
 
171 aa  70.9  7e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1759  putative CheW protein  31.16 
 
 
168 aa  70.5  9e-12  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  28.93 
 
 
179 aa  70.5  9e-12  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1667  putative CheW protein  39.09 
 
 
141 aa  70.5  1e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.33191  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  32.58 
 
 
533 aa  70.5  1e-11  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  26.92 
 
 
148 aa  70.1  1e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  27.97 
 
 
163 aa  70.1  1e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1963  CheW protein  31.16 
 
 
168 aa  70.5  1e-11  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.187208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  30.66 
 
 
168 aa  70.1  1e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  28.47 
 
 
515 aa  70.1  1e-11  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  28.57 
 
 
162 aa  69.7  2e-11  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  29.71 
 
 
155 aa  69.3  2e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0258  CheW protein  28.68 
 
 
152 aa  69.7  2e-11  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  5.34163e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  29.37 
 
 
165 aa  68.9  2e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46725e-13 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  29.37 
 
 
165 aa  68.9  2e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  32.65 
 
 
160 aa  69.3  2e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  29.85 
 
 
187 aa  68.9  3e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  30.23 
 
 
169 aa  68.9  3e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.04707e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  29.71 
 
 
155 aa  68.9  3e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  24.81 
 
 
150 aa  68.9  3e-11  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>