229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0287 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  100 
 
 
429 aa  874  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  40.05 
 
 
549 aa  313  3e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  48.35 
 
 
422 aa  255  9e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  38.85 
 
 
432 aa  254  1e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0287  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  36.14 
 
 
471 aa  225  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  37.95 
 
 
419 aa  222  9e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2285  hypothetical protein  34.57 
 
 
425 aa  219  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0313194  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  38.44 
 
 
447 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2909  restriction modification system DNA specificity subunit  32.38 
 
 
440 aa  206  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.54 
 
 
428 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  34.56 
 
 
420 aa  185  1e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2742  type I restriction-modification system specificity determinant  34.15 
 
 
398 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971087  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  34.2 
 
 
416 aa  179  6e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20210  restriction modification system DNA specificity domain protein  41.15 
 
 
565 aa  166  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266778  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  43.96 
 
 
511 aa  166  7e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1103  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.36 
 
 
400 aa  166  7e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0442932  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0871  restriction modification system DNA specificity subunit  50 
 
 
211 aa  165  2e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  33.8 
 
 
285 aa  163  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1095  restriction modification system DNA specificity subunit  53.24 
 
 
450 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  42.86 
 
 
476 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3144  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.38 
 
 
412 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527027  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4778  restriction modification system DNA specificity subunit  27.9 
 
 
415 aa  156  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16943  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0006  restriction modification system, type I  45.11 
 
 
412 aa  155  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  31.85 
 
 
429 aa  147  2e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1219  restriction modification system DNA specificity domain  32.02 
 
 
412 aa  147  5e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3297  restriction modification system DNA specificity subunit  49.66 
 
 
430 aa  142  2e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489204 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0878  type I restriction modification system methylase  27.61 
 
 
424 aa  134  4e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4472  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.56 
 
 
428 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2508  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  47.45 
 
 
401 aa  133  7e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.700746 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0041  restriction modification system DNA specificity subunit  30 
 
 
397 aa  131  2e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3180  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.74 
 
 
390 aa  131  2e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.82 
 
 
457 aa  130  4e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  29.01 
 
 
453 aa  130  6e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2606  restriction modification system DNA specificity subunit  28.31 
 
 
429 aa  129  8e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2016  restriction modification system DNA specificity subunit  27.06 
 
 
417 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0839323  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2910  putative type I restriction-modification system, S subunit  40.91 
 
 
373 aa  126  8e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0223  putative HsdS protein  29.64 
 
 
438 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  28.3 
 
 
456 aa  123  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3081  restriction modification system DNA specificity domain protein  41.78 
 
 
415 aa  122  1e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0836  type I restriction-modification system S subunit  29.2 
 
 
416 aa  121  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  29.56 
 
 
425 aa  120  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0549  restriction modification system DNA specificity subunit  31.44 
 
 
385 aa  119  1e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4241  restriction modification system DNA specificity subunit  29.62 
 
 
411 aa  118  2e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.491612  hitchhiker  0.00127278 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2722  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.37 
 
 
385 aa  118  2e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.99 
 
 
620 aa  118  2e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  29.43 
 
 
446 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2467  restriction modification system DNA specificity domain  25.71 
 
 
438 aa  116  8e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0005  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.96 
 
 
378 aa  115  1e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4930  type I restriction enzyme StySJI specificity protein  26.05 
 
 
469 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2415  restriction modification system DNA specificity domain  28.91 
 
 
418 aa  114  4e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.589349  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2791  type I restriction-modification system, S subunit  28.91 
 
 
418 aa  114  4e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4163  restriction modification system DNA specificity subunit  27.73 
 
 
405 aa  113  8e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.864984  normal  0.0584456 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  35.26 
 
 
417 aa  112  1e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  27.08 
 
 
417 aa  112  1e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1536  hypothetical protein  29.05 
 
 
380 aa  112  2e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00344436  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1941  restriction endonuclease S subunits-like  23.8 
 
 
451 aa  112  2e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0182546  normal  0.0682578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.35 
 
 
442 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1087  type I restriction-modification system, S subunit  25.36 
 
 
422 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2364  restriction modification system DNA specificity subunit  27.33 
 
 
413 aa  106  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.188022 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3382  restriction modification system DNA specificity subunit  25.98 
 
 
485 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.47 
 
 
427 aa  106  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0900  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.68 
 
 
471 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.963501 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1360  restriction modification system DNA specificity subunit  24.94 
 
 
453 aa  105  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  27.97 
 
 
426 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  27.22 
 
 
438 aa  104  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  24.67 
 
 
456 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2237  restriction modification system DNA specificity subunit  27.59 
 
 
412 aa  103  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  28.7 
 
 
439 aa  101  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  33.13 
 
 
402 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0086  restriction modification system DNA specificity protein  27.76 
 
 
538 aa  100  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1095  hypothetical protein  25.81 
 
 
401 aa  100  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1122  restriction endonuclease S subunits-like  27.46 
 
 
428 aa  99.4  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.878738  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  25.69 
 
 
426 aa  98.6  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  29.49 
 
 
409 aa  97.8  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  32.45 
 
 
442 aa  96.7  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0899  restriction endonuclease S subunit  38.81 
 
 
396 aa  95.9  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  6.81459e-08  hitchhiker  1.69581e-06 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4917  restriction modification system DNA specificity subunit  37.79 
 
 
412 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.544675 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  34.55 
 
 
846 aa  94.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1536  restriction modification system DNA specificity domain  26.36 
 
 
364 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1808  restriction modification system DNA specificity subunit  24.88 
 
 
483 aa  93.6  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300643  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0132  restriction modification system DNA specificity subunit  26.52 
 
 
427 aa  93.6  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.47299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7555  Restriction endonuclease S subunits-like protein  24.6 
 
 
402 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3132  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.99 
 
 
424 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.474681 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2673  restriction modification system DNA specificity subunit  33.75 
 
 
415 aa  91.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.574489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.14 
 
 
423 aa  90.9  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  26.03 
 
 
437 aa  90.1  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2926  restriction modification system DNA specificity subunit  34.39 
 
 
434 aa  90.1  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  28.83 
 
 
458 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  30.61 
 
 
430 aa  89  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1218  restriction modification system DNA specificity subunit  26.95 
 
 
351 aa  89.7  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.67755  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1091  restriction modification system DNA specificity domain protein  38.69 
 
 
444 aa  89  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3540  restriction modification system DNA specificity subunit  32.88 
 
 
387 aa  89  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  27.04 
 
 
435 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  1.59098e-06 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1566  restriction modification system DNA specificity subunit  26.77 
 
 
403 aa  87.8  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0293394  unclonable  1.92379e-05 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0864  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.01 
 
 
413 aa  87.8  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  27.27 
 
 
429 aa  87.4  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4083  restriction modification system DNA specificity subunit  24.23 
 
 
409 aa  86.7  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17660  restriction endonuclease S subunit  26.98 
 
 
416 aa  85.5  1e-15  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1221  restriction modification system DNA specificity subunit  39.02 
 
 
463 aa  85.5  2e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0149  restriction modification system DNA specificity subunit  24.85 
 
 
400 aa  84  4e-15  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>