More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0254 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  79.02 
 
 		 573 aa  939    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  60.73 
 
 		 583 aa  711    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  60.66 
 
 		 579 aa  709    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  60.84 
 
 		 579 aa  709    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  60.84 
 
 		 579 aa  710    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  60.84 
 
 		 583 aa  710    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  61.01 
 
 		 579 aa  710    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  60.31 
 
 		 579 aa  708    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  60.84 
 
 		 579 aa  709    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 573 aa  1161    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  60.14 
 
 		 579 aa  702    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  61.01 
 
 		 579 aa  711    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  60.38 
 
 		 579 aa  703    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  46.85 
 
 		 559 aa  506  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  44.64 
 
 		 555 aa  471  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  44.82 
 
 		 556 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  43.82 
 
 		 552 aa  451  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  42.15 
 
 		 558 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  40.21 
 
 		 566 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  42.81 
 
 		 559 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  42.81 
 
 		 559 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  41.48 
 
 		 555 aa  427  1e-118  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  41.68 
 
 		 558 aa  411  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  41.34 
 
 		 554 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  38.72 
 
 		 567 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  38.45 
 
 		 555 aa  392  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  39.23 
 
 		 565 aa  392  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  38.84 
 
 		 565 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  37.95 
 
 		 565 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  37.95 
 
 		 570 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  38.2 
 
 		 562 aa  385  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  38.78 
 
 		 565 aa  382  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  37.39 
 
 		 577 aa  376  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  39.47 
 
 		 554 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  39.01 
 
 		 601 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  37.37 
 
 		 557 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  35.93 
 
 		 561 aa  368  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  38.8 
 
 		 599 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  33.91 
 
 		 580 aa  365  1e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  38.53 
 
 		 586 aa  365  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  38.12 
 
 		 587 aa  364  2e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  36.17 
 
 		 551 aa  360  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  36.06 
 
 		 562 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  40.24 
 
 		 553 aa  355  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  38.4 
 
 		 578 aa  352  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  41.29 
 
 		 553 aa  350  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  34.55 
 
 		 561 aa  350  4e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  36.97 
 
 		 551 aa  350  4e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  38.53 
 
 		 556 aa  350  4e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  36.32 
 
 		 572 aa  348  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  36.4 
 
 		 552 aa  347  3e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  36.01 
 
 		 574 aa  346  6e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  39.02 
 
 		 572 aa  344  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  35.75 
 
 		 572 aa  343  4e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  35.85 
 
 		 554 aa  343  5.999999999999999e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  35.33 
 
 		 554 aa  340  4e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  35.55 
 
 		 554 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  38.18 
 
 		 560 aa  336  7.999999999999999e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  35.3 
 
 		 588 aa  335  9e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  35.47 
 
 		 588 aa  335  1e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  35.83 
 
 		 569 aa  335  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  34.97 
 
 		 605 aa  333  4e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  33.8 
 
 		 574 aa  331  3e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  35.66 
 
 		 560 aa  330  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  37.76 
 
 		 553 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  34.43 
 
 		 588 aa  323  4e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  35.46 
 
 		 565 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  34.13 
 
 		 593 aa  320  3e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  34.74 
 
 		 553 aa  318  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  34.08 
 
 		 575 aa  318  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  34.9 
 
 		 558 aa  316  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  34.02 
 
 		 559 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 		 580 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  35.24 
 
 		 558 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  34.33 
 
 		 574 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 556 aa  313  3.9999999999999997e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  33.57 
 
 		 608 aa  313  3.9999999999999997e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  32.7 
 
 		 553 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  34.09 
 
 		 559 aa  311  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  36.33 
 
 		 558 aa  309  8e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  34.26 
 
 		 567 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  34.92 
 
 		 553 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  34.92 
 
 		 553 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  34.92 
 
 		 553 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  35.54 
 
 		 557 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  34.92 
 
 		 553 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  35.88 
 
 		 564 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  33.39 
 
 		 552 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  33.98 
 
 		 568 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  34.92 
 
 		 553 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1453  DNA repair protein RecN  37.65 
 
 		 557 aa  307  3e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0975706  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  33.57 
 
 		 554 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  35.74 
 
 		 549 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  33.63 
 
 		 554 aa  306  7e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  37.28 
 
 		 551 aa  306  8.000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 580 aa  306  8.000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  33.8 
 
 		 555 aa  306  9.000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  34.8 
 
 		 558 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  33.92 
 
 		 557 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  33.28 
 
 		 570 aa  304  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>