More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0250 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 297 aa  598  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  73.4 
 
 		 297 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  57.91 
 
 		 297 aa  328  8e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  57.48 
 
 		 296 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  57.48 
 
 		 296 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  57.48 
 
 		 296 aa  323  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  57.48 
 
 		 296 aa  322  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  57.14 
 
 		 296 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  57.14 
 
 		 296 aa  320  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  57.14 
 
 		 296 aa  320  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  57.14 
 
 		 296 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  57.14 
 
 		 296 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  56.57 
 
 		 297 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  48.49 
 
 		 293 aa  268  5e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  51.27 
 
 		 296 aa  266  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  51.91 
 
 		 295 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  53.99 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  52.29 
 
 		 295 aa  264  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  47.77 
 
 		 300 aa  262  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  47.68 
 
 		 294 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  47.42 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  47.24 
 
 		 300 aa  258  7e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  47.24 
 
 		 299 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  51.32 
 
 		 301 aa  257  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  51.64 
 
 		 297 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  46.9 
 
 		 307 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  46.15 
 
 		 293 aa  251  9.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  46.15 
 
 		 293 aa  251  9.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  49.62 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  50.78 
 
 		 295 aa  249  6e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  51.56 
 
 		 297 aa  248  9e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  46.46 
 
 		 299 aa  248  9e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  46.46 
 
 		 299 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  51.91 
 
 		 290 aa  247  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  48.67 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  46.13 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  48.48 
 
 		 297 aa  246  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  48.67 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  44.11 
 
 		 309 aa  246  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  47.35 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  53.91 
 
 		 290 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  46.71 
 
 		 306 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  45.17 
 
 		 320 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  47.08 
 
 		 316 aa  241  9e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  47.49 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  55.08 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  51.49 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  47.12 
 
 		 294 aa  236  5.0000000000000005e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  51.66 
 
 		 297 aa  235  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  45 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  47.12 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  47.64 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  45.15 
 
 		 299 aa  228  7e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  50.94 
 
 		 296 aa  228  7e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  45.76 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  45.59 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  46.23 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0267  polyprenyl synthetase  45.3 
 
 		 334 aa  222  6e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.879349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  41.46 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  45.8 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  47.29 
 
 		 296 aa  219  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  46.09 
 
 		 290 aa  219  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  48.46 
 
 		 299 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  50.21 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  45.7 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  43.6 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  49.12 
 
 		 315 aa  215  9e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  44.96 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  43.97 
 
 		 297 aa  212  7e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  42.03 
 
 		 296 aa  211  7.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  45.63 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  47.86 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  50.22 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  46.94 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  45.12 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  46.43 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  44.72 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  45.52 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  47.04 
 
 		 298 aa  206  4e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  46.94 
 
 		 291 aa  206  4e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  50.19 
 
 		 300 aa  205  8e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  50.21 
 
 		 295 aa  202  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  46.69 
 
 		 286 aa  201  9e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  46.78 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  46.48 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  45.13 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  48.5 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  50.2 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0926  farnesyl-diphosphate synthase  43.66 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.19869  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3252  geranyltranstransferase  50.38 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  42.75 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3111  geranyltranstransferase  50.38 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  49.39 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  49.39 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3073  geranyltranstransferase  50 
 
 		 306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  47.17 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  41.22 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2512  polyprenyl synthetase  35.8 
 
 		 335 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  50.86 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>