More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0125 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 62 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  93.55 
 
 		 62 aa  120  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  71.19 
 
 		 60 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  71.19 
 
 		 60 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  71.19 
 
 		 60 aa  88.2  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  71.19 
 
 		 60 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  71.19 
 
 		 60 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  71.19 
 
 		 60 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  71.19 
 
 		 60 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  71.19 
 
 		 60 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  71.19 
 
 		 60 aa  87.8  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  69.49 
 
 		 60 aa  87.8  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  69.49 
 
 		 60 aa  87  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  69.64 
 
 		 59 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  69.64 
 
 		 59 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  65 
 
 		 61 aa  78.2  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  66.07 
 
 		 60 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  69.64 
 
 		 59 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 59 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  62.71 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 60 aa  73.6  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  63.33 
 
 		 61 aa  72.8  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  57.38 
 
 		 61 aa  71.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0243  ribosomal protein L30  67.35 
 
 		 51 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2693  ribosomal protein L30  54.84 
 
 		 62 aa  69.7  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1556  ribosomal protein L30  56.9 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000500993  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  60.38 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  55 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2442  50S ribosomal protein L30P  52.63 
 
 		 60 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 61 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  54.84 
 
 		 62 aa  65.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 59 aa  65.5  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0785  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 61 aa  65.5  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00447996  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0840  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 62 aa  65.1  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1364  ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 58 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000295854  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 59 aa  63.5  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  50.88 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  51.72 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 58 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1725  50S ribosomal protein L30  50.82 
 
 		 61 aa  62.8  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000657277  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 62 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  50.85 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0212  LSU ribosomal protein L30P  50.85 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161029  normal  0.28126 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  48.28 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1310  50S ribosomal protein L30  57.41 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988415  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1376  50S ribosomal protein L30  57.41 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0327114  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3001  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3161  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158521  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03153  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00272403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0411  ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158772  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0411  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000870321  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4625  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3496  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000235964  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3687  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288891  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  54.24 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3597  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0159663  normal  0.022282 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1143  ribosomal protein L30  56.67 
 
 		 61 aa  60.8  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000025708  normal  0.0109898 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3785  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000084288  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2696  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 57 aa  60.5  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2381  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 57 aa  60.5  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3618  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00151537  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 63 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0313  ribosomal protein L30  56.9 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00845621  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3931  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3726  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.990578  normal  0.0950772 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3691  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0510411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3618  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0118319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  48.28 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3789  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3804  ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00029637  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0303  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3649  50S ribosomal protein L30  55 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000866459  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  46.55 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>