More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0113 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 218 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  95.41 
 
 		 218 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  88.13 
 
 		 219 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  87.21 
 
 		 219 aa  390  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  86.76 
 
 		 219 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  86.76 
 
 		 219 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  86.76 
 
 		 219 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  86.76 
 
 		 219 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  86.76 
 
 		 219 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  86.76 
 
 		 219 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  86.76 
 
 		 219 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  86.76 
 
 		 219 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  86.76 
 
 		 219 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  77.98 
 
 		 217 aa  356  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  78.9 
 
 		 217 aa  355  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  78.9 
 
 		 217 aa  355  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  76.02 
 
 		 221 aa  345  3e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  76.61 
 
 		 217 aa  344  7e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  77.52 
 
 		 217 aa  342  2.9999999999999997e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  77.21 
 
 		 226 aa  341  5.999999999999999e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  77.25 
 
 		 217 aa  338  4e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  71.69 
 
 		 219 aa  329  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  71.43 
 
 		 219 aa  322  3e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  71.56 
 
 		 222 aa  322  3e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  70.05 
 
 		 221 aa  320  8e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  68.35 
 
 		 220 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  66.67 
 
 		 219 aa  307  9e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  67.58 
 
 		 218 aa  306  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  67.14 
 
 		 226 aa  305  4.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  67.79 
 
 		 229 aa  305  5.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  66.67 
 
 		 222 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  67.46 
 
 		 214 aa  299  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  68.35 
 
 		 220 aa  300  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  66.36 
 
 		 238 aa  297  9e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0202  SSU ribosomal protein S3P  66.82 
 
 		 223 aa  296  2e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0598468  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 210 aa  295  5e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  67.58 
 
 		 222 aa  294  6e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  63.03 
 
 		 211 aa  294  7e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  63.03 
 
 		 211 aa  291  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  63.03 
 
 		 211 aa  290  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  63.03 
 
 		 211 aa  290  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  63.81 
 
 		 210 aa  290  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 210 aa  287  7e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  62.79 
 
 		 223 aa  286  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  63.85 
 
 		 222 aa  286  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  63.85 
 
 		 222 aa  286  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2327  30S ribosomal protein S3  65.09 
 
 		 227 aa  283  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000359117  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  62.02 
 
 		 224 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  62.02 
 
 		 224 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  62.44 
 
 		 221 aa  282  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  62.02 
 
 		 224 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1789  SSU ribosomal protein S3P  61.11 
 
 		 234 aa  282  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.309908  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5781  ribosomal protein S3  63.59 
 
 		 302 aa  280  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.336905 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  60.56 
 
 		 224 aa  280  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  61.93 
 
 		 227 aa  279  3e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  61.93 
 
 		 227 aa  279  3e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  60.65 
 
 		 235 aa  277  7e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  61.35 
 
 		 210 aa  277  8e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  62.04 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  59.26 
 
 		 237 aa  275  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  61.11 
 
 		 252 aa  275  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  64.42 
 
 		 228 aa  275  4e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  63.46 
 
 		 245 aa  275  5e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  59.72 
 
 		 260 aa  274  9e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  57.41 
 
 		 243 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  63.46 
 
 		 226 aa  273  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1722  30S ribosomal protein S3  61.57 
 
 		 238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094862  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2528  30S ribosomal protein S3  61.57 
 
 		 238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0367  30S ribosomal protein S3  61.57 
 
 		 238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  59.26 
 
 		 236 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  59.26 
 
 		 236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  59.72 
 
 		 262 aa  272  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 232 aa  272  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  59.26 
 
 		 236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0601  SSU ribosomal protein S3P  62.44 
 
 		 267 aa  272  2.0000000000000002e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000507952  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  57.41 
 
 		 243 aa  272  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4349  30S ribosomal protein S3  61.17 
 
 		 275 aa  272  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122787  normal  0.048354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  61.43 
 
 		 236 aa  272  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  62.04 
 
 		 235 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  62.04 
 
 		 232 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0411  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 233 aa  271  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0065  30S ribosomal protein S3  63.46 
 
 		 235 aa  271  4.0000000000000004e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0358705  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3816  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 233 aa  271  5.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000890302  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3995  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 233 aa  271  5.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0329  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 233 aa  271  6e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000157005  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  60.19 
 
 		 236 aa  271  6e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  61.57 
 
 		 231 aa  270  9e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03165  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00374176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0399  ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000257024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0399  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000141068  hitchhiker  0.0000729403 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3508  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538349  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3699  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153229  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  61.57 
 
 		 231 aa  270  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0255  30S ribosomal protein S3  59.72 
 
 		 239 aa  270  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3745  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000025032  hitchhiker  0.00113301 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3703  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4637  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00278022  normal  0.0942567 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3801  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0443981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3738  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.338082  normal  0.0279522 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3609  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000291269  normal  0.0112128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>