55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0101 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0101  putative ribosomal protein L7Ae-like  100 
 
 
82 aa  157  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0105  putative ribosomal protein L7Ae-like  86.59 
 
 
82 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000154657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0098  hypothetical protein  48.15 
 
 
82 aa  85.5  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000338227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0125  hypothetical protein  49.38 
 
 
82 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0104  hypothetical protein  46.91 
 
 
93 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000288714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0116  hypothetical protein  46.91 
 
 
82 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.74724e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0104  hypothetical protein  46.91 
 
 
93 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000573275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0100  hypothetical protein  46.91 
 
 
93 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000444841  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0098  hypothetical protein  46.91 
 
 
93 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182095  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0104  hypothetical protein  46.91 
 
 
82 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0135  hypothetical protein  46.91 
 
 
82 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000655713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5201  hypothetical protein  46.91 
 
 
82 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000267841  unclonable  7.36265e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0099  hypothetical protein  46.91 
 
 
82 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2466  50S ribosomal protein L7AE  44.44 
 
 
83 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1530  hypothetical protein  43.21 
 
 
83 aa  70.1  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100287  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2717  hypothetical protein  44.58 
 
 
85 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.133406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01110  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  44.29 
 
 
82 aa  67.8  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000450722  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0209  ribosomal protein L7ae family protein  41.25 
 
 
83 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343834  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0185  putative ribosomal protein L7Ae-like  37.35 
 
 
86 aa  62  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000360647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2726  50S ribosomal protein L7AE  37.33 
 
 
79 aa  61.6  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000168835  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0314  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  39.47 
 
 
80 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0567  putative ribosomal protein L7Ae-like  36.9 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000530013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0581  putative ribosomal protein L7Ae-like  36.9 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00254265  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0219  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000001803  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0188  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.8 
 
 
82 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158603  decreased coverage  0.00101223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0280  putative ribosomal protein L7Ae-like protein  37.8 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000000500453  decreased coverage  0.00000955735 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  39.29 
 
 
130 aa  51.6  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0416  ribosomal protein L7AE family protein  39.71 
 
 
83 aa  50.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000181498  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2339  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  40 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000362211  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0589  50S ribosomal protein L7Ae  40 
 
 
169 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.962005  hitchhiker  0.000204671 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0806  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.76 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000124413  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  38.46 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0861  putative L7Ae-like ribosomal protein  37.68 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000301408  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1580  50S ribosomal protein L7Ae  40 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0283  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.84 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1759  50S ribosomal protein L7Ae  40 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217268  hitchhiker  0.000585072 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2621  50S ribosomal protein L7Ae  39.19 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302096  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1842  50S ribosomal protein L7Ae  36 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00104534  normal  0.186642 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0451  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  33.33 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202723  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2406  ribosomal protein L7AE family protein  34.72 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000118333  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0750  50S ribosomal protein L7Ae  37.84 
 
 
120 aa  42.7  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2720  ribosomal protein L7AE family protein  34.72 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000573483  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3826  hypothetical protein  32.79 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.46605e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3912  hypothetical protein  32.79 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0236889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3861  hypothetical protein  32.79 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000181843  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0443  50S ribosomal protein L7Ae  40.98 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3951  hypothetical protein  32.79 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00360527  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3573  hypothetical protein  32.79 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00318264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3555  hypothetical protein  32.79 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3665  hypothetical protein  32.79 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000505852  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2527  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.67 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3852  hypothetical protein  32.79 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0106157  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1846  50S ribosomal protein L7Ae  33.33 
 
 
164 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1332  hypothetical protein  32.79 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000143752  hitchhiker  0.0000753067 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2466  hypothetical protein  31.15 
 
 
103 aa  40.8  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000938075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>