More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0093 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 
177 aa  357  4e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  89.83 
 
 
177 aa  307  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  70.86 
 
 
182 aa  258  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  70.86 
 
 
182 aa  258  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  77.4 
 
 
177 aa  252  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  68.57 
 
 
182 aa  251  5.000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  76.84 
 
 
177 aa  248  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  76.84 
 
 
177 aa  248  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  76.84 
 
 
177 aa  248  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  76.84 
 
 
177 aa  248  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  76.84 
 
 
177 aa  248  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  76.84 
 
 
177 aa  248  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  76.84 
 
 
177 aa  248  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  76.84 
 
 
177 aa  249  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  76.84 
 
 
177 aa  248  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  67.8 
 
 
175 aa  239  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  66.1 
 
 
174 aa  239  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  60.45 
 
 
181 aa  238  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  64.41 
 
 
175 aa  235  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  67.23 
 
 
175 aa  226  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  61.49 
 
 
180 aa  225  2e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  60.11 
 
 
203 aa  225  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  60.23 
 
 
183 aa  224  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  57.95 
 
 
175 aa  222  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  58.76 
 
 
178 aa  221  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  58.62 
 
 
188 aa  218  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  63.84 
 
 
175 aa  217  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  57.95 
 
 
194 aa  216  8.999999999999998e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  57.39 
 
 
187 aa  215  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  56.82 
 
 
194 aa  214  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  61.93 
 
 
176 aa  213  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  61.36 
 
 
172 aa  208  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0268  transcription antitermination protein nusG  54.95 
 
 
192 aa  207  5e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000582831  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1422  transcription antitermination protein nusG  58.43 
 
 
185 aa  201  6e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.002098  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  56.65 
 
 
174 aa  197  7e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  57.95 
 
 
177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  54.55 
 
 
177 aa  194  8.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  52.51 
 
 
181 aa  193  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  54.55 
 
 
177 aa  192  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  53.98 
 
 
177 aa  192  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  55.17 
 
 
201 aa  192  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  56.65 
 
 
173 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  56.65 
 
 
173 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  51.34 
 
 
266 aa  188  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  50.26 
 
 
280 aa  185  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  51.69 
 
 
177 aa  184  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  48.69 
 
 
267 aa  184  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  48.65 
 
 
306 aa  184  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  50.86 
 
 
199 aa  184  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  48.31 
 
 
243 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  47.96 
 
 
238 aa  182  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  48.62 
 
 
266 aa  181  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  51.1 
 
 
178 aa  181  6e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  51.38 
 
 
228 aa  181  6e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  50.28 
 
 
178 aa  181  7e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  50.86 
 
 
188 aa  181  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  50.28 
 
 
176 aa  180  8.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 
250 aa  180  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  46.56 
 
 
272 aa  180  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2062  transcription antitermination protein NusG  49.72 
 
 
179 aa  179  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0263  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 
179 aa  179  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000027375  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2406  transcription antitermination protein NusG  52.54 
 
 
185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337578  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  48.09 
 
 
242 aa  178  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  48.09 
 
 
242 aa  178  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  52.6 
 
 
172 aa  178  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  48.85 
 
 
197 aa  178  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  47.98 
 
 
276 aa  177  9e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  47.75 
 
 
177 aa  177  9e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  50.29 
 
 
199 aa  177  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  46.91 
 
 
272 aa  176  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  46.15 
 
 
270 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  46.15 
 
 
270 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  49.72 
 
 
273 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  48.6 
 
 
175 aa  176  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  50 
 
 
198 aa  176  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  47.24 
 
 
299 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  46.15 
 
 
271 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  49.71 
 
 
192 aa  175  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  45.64 
 
 
266 aa  176  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3902  transcription antitermination protein nusG  47.7 
 
 
196 aa  175  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  49.72 
 
 
277 aa  175  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  46.49 
 
 
273 aa  175  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  47.7 
 
 
196 aa  175  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  50.57 
 
 
202 aa  175  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  47.19 
 
 
175 aa  174  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  47.75 
 
 
177 aa  174  5e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  49.43 
 
 
203 aa  174  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  48.59 
 
 
185 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  48.59 
 
 
185 aa  174  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  48.59 
 
 
185 aa  174  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  48.59 
 
 
185 aa  174  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  48.59 
 
 
185 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  48.59 
 
 
185 aa  174  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  48.59 
 
 
185 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  48.02 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  48.02 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  48.02 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  48.02 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  48.02 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  47.19 
 
 
175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>