More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0088 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  100 
 
 
246 aa  501  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  84.9 
 
 
245 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  72.95 
 
 
247 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  72.95 
 
 
247 aa  378  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  72.13 
 
 
247 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  72.54 
 
 
247 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  72.54 
 
 
247 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  72.54 
 
 
247 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  72.54 
 
 
247 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  72.54 
 
 
247 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  72.54 
 
 
247 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  72.54 
 
 
247 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  72.54 
 
 
247 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  60.33 
 
 
248 aa  298  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  60.33 
 
 
248 aa  298  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  58.85 
 
 
249 aa  292  4e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0172  RNA methyltransferase  57.44 
 
 
249 aa  289  3e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0806813  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  55.56 
 
 
249 aa  281  1e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  53.33 
 
 
315 aa  274  9e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  50 
 
 
247 aa  271  9e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  57.02 
 
 
243 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  51.04 
 
 
277 aa  264  8e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3322  RNA methyltransferase  54.62 
 
 
248 aa  257  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.752431  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  52.89 
 
 
246 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2481  RNA methyltransferase TrmH, group 3  53.11 
 
 
246 aa  249  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314444  hitchhiker  0.00338936 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  52.26 
 
 
246 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  47.92 
 
 
289 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  47.5 
 
 
289 aa  241  7e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  49.79 
 
 
255 aa  239  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  48.96 
 
 
244 aa  235  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.53 
 
 
253 aa  231  5e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000129806  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0340  rRNA methylase  45.9 
 
 
251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000065422  hitchhiker  0.000000457527 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  47.33 
 
 
261 aa  224  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  45.31 
 
 
248 aa  222  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1425  rRNA methylase  47.62 
 
 
233 aa  221  8e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022514  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.23 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  45.42 
 
 
251 aa  217  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.46 
 
 
247 aa  217  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3773  RNA methyltransferase  45.56 
 
 
246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  47.33 
 
 
256 aa  214  8e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0122  tRNA/rRNA methyltransferase  45.87 
 
 
247 aa  214  8e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  46.91 
 
 
256 aa  214  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  46.5 
 
 
245 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2065  rRNA methylase  47.08 
 
 
242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  43.85 
 
 
323 aa  213  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  46.5 
 
 
256 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.85 
 
 
327 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.67 
 
 
292 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.67 
 
 
292 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2398  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.34 
 
 
248 aa  204  8e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.670056 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1909  RNA methyltransferase  45.08 
 
 
256 aa  203  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000520024  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.92 
 
 
349 aa  202  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.988579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  43.23 
 
 
250 aa  201  9e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2067  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.62 
 
 
326 aa  201  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  41.32 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  44.58 
 
 
245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  46.03 
 
 
246 aa  199  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3458  RNA methyltransferase  44.49 
 
 
252 aa  199  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.92 
 
 
246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4616  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  42.15 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0851  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.5 
 
 
336 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.367945  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4216  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  44.09 
 
 
245 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.36 
 
 
247 aa  195  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0753  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  42.32 
 
 
246 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0205206  hitchhiker  0.000134961 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2692  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  47.6 
 
 
252 aa  194  8.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107399  normal  0.310165 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3589  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  42.32 
 
 
246 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124331  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3934  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  42.21 
 
 
246 aa  194  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.32 
 
 
387 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  44.05 
 
 
248 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3066  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  45.25 
 
 
240 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  44.49 
 
 
248 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  44.44 
 
 
242 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1055  tyrosyl-tRNA synthetase, class Ib  43.15 
 
 
248 aa  193  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3263  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  42.21 
 
 
246 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000357773  hitchhiker  0.0000120778 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09121  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.46 
 
 
335 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0698  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  42.21 
 
 
246 aa  192  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000126768  hitchhiker  0.000148247 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15801  rRNA methylase  45.45 
 
 
536 aa  192  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0684  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  41.8 
 
 
246 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  hitchhiker  0.000276778 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  41.25 
 
 
245 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  42.15 
 
 
248 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1155  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.17 
 
 
542 aa  190  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623752  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  41.7 
 
 
248 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  42.6 
 
 
248 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0262  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.39 
 
 
416 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19440  rRNA methylase, putative, group 3  43.5 
 
 
256 aa  190  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000129696 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2119  RNA methyltransferase TrmH, group 3  45.04 
 
 
519 aa  190  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383182 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  42.15 
 
 
248 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0003  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.33 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0190  RNA methyltransferase  44.54 
 
 
251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.153268  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.39 
 
 
442 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0566162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0971  rRNA methylase-like protein  44.72 
 
 
322 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.67 
 
 
250 aa  188  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4020  RNA methyltransferase  42.15 
 
 
314 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.980605  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5337  RNA methyltransferase  40.25 
 
 
314 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2176  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  45.25 
 
 
247 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000213076  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1304  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.63 
 
 
652 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.33 
 
 
254 aa  186  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09101  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.35 
 
 
334 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0974  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.8 
 
 
316 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0708  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  42.32 
 
 
246 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.106779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>