More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0080 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  71.71 
 
 		 458 aa  679    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  71.49 
 
 		 458 aa  677    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  71.71 
 
 		 458 aa  679    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  71.93 
 
 		 458 aa  681    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  71.93 
 
 		 458 aa  682    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  71.49 
 
 		 458 aa  677    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  71.71 
 
 		 458 aa  679    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  71.93 
 
 		 458 aa  683    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  71.93 
 
 		 458 aa  681    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  72.15 
 
 		 458 aa  681    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  71.71 
 
 		 458 aa  679    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  86.18 
 
 		 457 aa  811    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 484 aa  987    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  64.32 
 
 		 457 aa  601  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  64.25 
 
 		 454 aa  594  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  64.25 
 
 		 454 aa  594  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  64.9 
 
 		 454 aa  593  1e-168  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  63.16 
 
 		 457 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  63.66 
 
 		 453 aa  572  1.0000000000000001e-162  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  60.79 
 
 		 470 aa  561  1.0000000000000001e-159  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  60.26 
 
 		 454 aa  555  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  65.84 
 
 		 415 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  64.57 
 
 		 408 aa  525  1e-148  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  57.4 
 
 		 453 aa  524  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  56.98 
 
 		 453 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  57.08 
 
 		 448 aa  513  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  57.74 
 
 		 449 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  55.75 
 
 		 450 aa  508  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  54.39 
 
 		 459 aa  510  1e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  56.73 
 
 		 449 aa  504  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  58.15 
 
 		 448 aa  504  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  56.02 
 
 		 460 aa  501  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  55.73 
 
 		 449 aa  501  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  54.8 
 
 		 489 aa  497  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  57.89 
 
 		 450 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  55.85 
 
 		 452 aa  491  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  53.66 
 
 		 457 aa  488  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  51.65 
 
 		 457 aa  483  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  54.53 
 
 		 452 aa  484  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  52.41 
 
 		 476 aa  478  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  51.22 
 
 		 520 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  51.53 
 
 		 507 aa  477  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  55.02 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  50.91 
 
 		 514 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  52.33 
 
 		 457 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  50.91 
 
 		 514 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  53.08 
 
 		 461 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  54.26 
 
 		 445 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  52.21 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  52.21 
 
 		 452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  52.2 
 
 		 465 aa  468  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  50.41 
 
 		 517 aa  467  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  51.52 
 
 		 451 aa  465  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 518 aa  463  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3606  DNA repair protein RadA  55.24 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  48.48 
 
 		 458 aa  461  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 		 455 aa  462  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  51.52 
 
 		 462 aa  458  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  52.43 
 
 		 453 aa  460  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  48.9 
 
 		 451 aa  461  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  52.32 
 
 		 446 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3565  DNA repair protein RadA  56.43 
 
 		 471 aa  455  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  0.041039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  50.22 
 
 		 457 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  50.47 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  51.75 
 
 		 451 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3538  DNA repair protein RadA  55.24 
 
 		 462 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  53.36 
 
 		 478 aa  449  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  49.45 
 
 		 453 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  49.67 
 
 		 453 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  52.1 
 
 		 453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  50.77 
 
 		 462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2817  DNA repair protein RadA  55.12 
 
 		 452 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2440  DNA repair protein RadA  55.12 
 
 		 452 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.526497  hitchhiker  0.000264442 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  49.23 
 
 		 451 aa  442  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0927  DNA repair protein RadA  49.69 
 
 		 482 aa  443  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1487  DNA repair protein RadA  49.37 
 
 		 481 aa  442  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  51.32 
 
 		 456 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  49.23 
 
 		 451 aa  442  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  51.66 
 
 		 453 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 		 462 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  51.1 
 
 		 456 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  51.53 
 
 		 455 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  52.42 
 
 		 467 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  51.53 
 
 		 455 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  51.42 
 
 		 477 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  51.1 
 
 		 456 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0926  DNA repair protein RadA  50.23 
 
 		 455 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  51.31 
 
 		 458 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  51.31 
 
 		 458 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1348  DNA repair protein RadA  52.17 
 
 		 460 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2017  DNA repair protein RadA  51.32 
 
 		 464 aa  435  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  50.55 
 
 		 448 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  51.42 
 
 		 455 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2252  DNA repair protein RadA  49.47 
 
 		 472 aa  437  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  50.93 
 
 		 464 aa  436  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  52.56 
 
 		 463 aa  436  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0571  DNA repair protein RadA  49.45 
 
 		 494 aa  433  1e-120  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  51.2 
 
 		 453 aa  435  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  46.17 
 
 		 454 aa  434  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0314  DNA repair protein RadA  52.72 
 
 		 476 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>