39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0076 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0076  transcriptional repressor, CtsR  100 
 
 
153 aa  307  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0080  transcriptional repressor, CtsR  90.2 
 
 
153 aa  283  8e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000901486  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0073  transcriptional repressor, CtsR  67.32 
 
 
153 aa  222  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173946  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0078  transcriptional regulator CtsR  65.36 
 
 
153 aa  220  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0088  transcriptional regulator CtsR  65.36 
 
 
153 aa  220  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24686e-40 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0108  transcriptional regulator CtsR  65.36 
 
 
153 aa  220  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000174069  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0077  transcriptional regulator CtsR  65.36 
 
 
153 aa  220  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00235802  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0078  transcriptional regulator CtsR  65.36 
 
 
153 aa  220  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0075  transcriptional regulator  65.36 
 
 
153 aa  220  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0074  transcriptional regulator  65.36 
 
 
153 aa  220  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.633336  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5227  transcriptional regulator CtsR  65.36 
 
 
153 aa  220  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000820485  hitchhiker  5.82448e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0099  transcriptional regulator CtsR  65.36 
 
 
153 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00122977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0073  transcriptional repressor, CtsR  64.05 
 
 
153 aa  216  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00398786  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0513  transcriptional repressor of class III stress genes  53.59 
 
 
160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.162127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0252  transcriptional repressor, CtsR  49.67 
 
 
158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.393745 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0177  Firmicute transcriptional repressor of class III stress genes  50.67 
 
 
154 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0544  transcriptional repressor, CtsR  50 
 
 
153 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0558  Firmicute transcriptional repressor of class III stress genes  50 
 
 
153 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0162  transcriptional regulator CtsR  50 
 
 
153 aa  158  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1828  transcriptional repressor, CtsR  49.33 
 
 
152 aa  154  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000526756  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1495  transcriptional repressor, CtsR  50.66 
 
 
155 aa  148  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000151028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00840  transcriptional repressor, CtsR  46 
 
 
157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.292684  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2743  transcriptional repressor, CtsR  53.28 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.280232  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0143  transcriptional repressor, CtsR  44.16 
 
 
154 aa  136  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1829  transcriptional regulator CtsR  47.71 
 
 
154 aa  136  8.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0244225  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0832  transcriptional repressor, CtsR  44.22 
 
 
152 aa  136  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0126757  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0178  Firmicute transcriptional repressor of class III stress genes  40.91 
 
 
174 aa  134  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.791  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1792  Firmicute transcriptional repressor of class III stress genes  44.08 
 
 
153 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0324  transcriptional repressor, CtsR  44.37 
 
 
152 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0151565  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0386  transcriptional repressor, CtsR  41.33 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000276143  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0108  class III stress gene transcriptional regulator  50 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00387323  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0665  transcriptional repressor of class III stress genes  49.15 
 
 
151 aa  120  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2440  transcriptional repressor  42 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2754  transcriptional repressor  41.33 
 
 
151 aa  117  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0495199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0159  transcriptional regulator  46.02 
 
 
122 aa  114  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1405  transcriptional repressor, CtsR  34.62 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1951  transcriptional repressor, CtsR  40.34 
 
 
155 aa  106  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0224178  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0124  transcriptional repressor, CtsR  37.5 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.407779  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2370  transcriptional repressor of class III stress genes-like protein  36.29 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000351373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>