279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0072 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0072  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 73 aa  144  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0075  transcriptional regulator, XRE family  82.86 
 
 		 73 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  72.73 
 
 		 67 aa  104  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  71.21 
 
 		 67 aa  103  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  71.21 
 
 		 67 aa  103  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  69.7 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  69.7 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  69.7 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  69.7 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  69.7 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  69.7 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  69.7 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0070  XRE family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 52 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  49.28 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000425004  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 252 aa  50.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  43.1 
 
 		 387 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 256 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1747  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 436 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 505 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  42.62 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2752  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  42.37 
 
 		 255 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 188 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 212 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  40.32 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  43.75 
 
 		 488 aa  47.4  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 72 aa  47  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 255 aa  47.4  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 180 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 173 aa  47  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 180 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 180 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4268  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 180 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 180 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 97 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 180 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2940  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  37.7 
 
 		 209 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  37.14 
 
 		 513 aa  45.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 203 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  44.07 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  41.38 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2889  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 223 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  35.82 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1231  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 224 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  36.67 
 
 		 302 aa  44.7  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 504 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 219 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2568  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 223 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1025  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 219 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 191 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 235 aa  44.7  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1868  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  37.7 
 
 		 200 aa  44.3  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1992  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2077  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 201 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  34.38 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>