More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0044 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 		 315 aa  638    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  94.6 
 
 		 315 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  85.11 
 
 		 317 aa  547  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  84.47 
 
 		 317 aa  543  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  84.47 
 
 		 317 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  84.47 
 
 		 317 aa  543  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  84.47 
 
 		 317 aa  543  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  84.47 
 
 		 317 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  84.47 
 
 		 317 aa  543  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  84.47 
 
 		 317 aa  543  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  84.47 
 
 		 317 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  84.47 
 
 		 317 aa  543  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  84.47 
 
 		 317 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0535  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.78 
 
 		 321 aa  471  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0143488  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0522  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.78 
 
 		 321 aa  471  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00402651  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0138  ribose-phosphate pyrophosphokinase  77.49 
 
 		 321 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.056526  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.68 
 
 		 329 aa  456  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.78 
 
 		 314 aa  451  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  68.99 
 
 		 327 aa  451  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.99 
 
 		 322 aa  437  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.39 
 
 		 325 aa  433  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0873  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.41 
 
 		 324 aa  432  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.23 
 
 		 313 aa  430  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.62 
 
 		 316 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.13 
 
 		 316 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  66.13 
 
 		 326 aa  421  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0043  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.33 
 
 		 321 aa  424  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.270111  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.81 
 
 		 315 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.02 
 
 		 322 aa  420  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.34 
 
 		 319 aa  418  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.98 
 
 		 319 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.98 
 
 		 319 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.13 
 
 		 318 aa  413  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.03 
 
 		 317 aa  412  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  60.76 
 
 		 317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0018  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.45 
 
 		 322 aa  403  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00325732  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.87 
 
 		 314 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2630  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.05 
 
 		 320 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.81 
 
 		 329 aa  379  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.16 
 
 		 338 aa  380  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.84 
 
 		 330 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.62 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.23 
 
 		 338 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.46 
 
 		 318 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.46 
 
 		 318 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.69 
 
 		 331 aa  372  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.68 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.96 
 
 		 316 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.63 
 
 		 320 aa  364  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0161  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.74 
 
 		 316 aa  363  2e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.37 
 
 		 314 aa  363  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.31 
 
 		 323 aa  362  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.28 
 
 		 359 aa  361  7.0000000000000005e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.05 
 
 		 314 aa  360  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.13 
 
 		 330 aa  360  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.32 
 
 		 316 aa  360  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.49 
 
 		 315 aa  360  1e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767857  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  56.68 
 
 		 321 aa  360  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.01 
 
 		 316 aa  359  3e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.23 
 
 		 318 aa  358  5e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 		 314 aa  358  8e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 		 321 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 		 321 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 		 321 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0609  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.01 
 
 		 324 aa  357  1.9999999999999998e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.81 
 
 		 321 aa  355  7.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 		 315 aa  355  7.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.63 
 
 		 316 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.47 
 
 		 320 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.96 
 
 		 318 aa  353  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.47 
 
 		 320 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.63 
 
 		 316 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.47 
 
 		 320 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  56.82 
 
 		 321 aa  353  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.82 
 
 		 321 aa  353  2e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1163  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.19 
 
 		 315 aa  353  2e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.285484  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  56.49 
 
 		 319 aa  352  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.84 
 
 		 325 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0951  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.17 
 
 		 324 aa  351  8e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.87 
 
 		 315 aa  351  1e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.31 
 
 		 320 aa  350  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.63 
 
 		 318 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.84 
 
 		 320 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.31 
 
 		 318 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.31 
 
 		 320 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.84 
 
 		 324 aa  350  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.87 
 
 		 312 aa  350  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.19 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.96 
 
 		 318 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0435  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.81 
 
 		 324 aa  349  3e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.187137  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.96 
 
 		 318 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.73 
 
 		 331 aa  349  3e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.96 
 
 		 318 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.96 
 
 		 318 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.96 
 
 		 318 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.96 
 
 		 318 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.96 
 
 		 318 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.63 
 
 		 318 aa  349  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0412  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.6 
 
 		 324 aa  349  4e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>