More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0032 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  100 
 
 
256 aa  530  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  83.98 
 
 
256 aa  454  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  78.74 
 
 
255 aa  421  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  77.25 
 
 
255 aa  418  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  77.25 
 
 
255 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  77.25 
 
 
255 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  77.25 
 
 
255 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  77.25 
 
 
255 aa  417  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  77.25 
 
 
255 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  76.86 
 
 
255 aa  417  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  76.86 
 
 
255 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  76.47 
 
 
255 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  76.47 
 
 
255 aa  413  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  62.89 
 
 
257 aa  344  6e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  62.89 
 
 
257 aa  344  6e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  61.72 
 
 
256 aa  342  2e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  51.57 
 
 
257 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  55.91 
 
 
255 aa  281  6.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  50.2 
 
 
257 aa  281  8.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  51.18 
 
 
255 aa  274  9e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  51.76 
 
 
256 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  47.24 
 
 
464 aa  267  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  50.59 
 
 
256 aa  266  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  47.24 
 
 
255 aa  261  6.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  47.84 
 
 
606 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  47.45 
 
 
462 aa  259  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  46.43 
 
 
256 aa  259  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  44.88 
 
 
260 aa  254  7e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  48.22 
 
 
251 aa  254  7e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  47.06 
 
 
256 aa  249  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  45.45 
 
 
258 aa  249  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  43.58 
 
 
462 aa  249  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  48.44 
 
 
255 aa  247  1e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  45.67 
 
 
253 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  48.05 
 
 
255 aa  246  3e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  44.09 
 
 
256 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  43.7 
 
 
256 aa  241  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  44.49 
 
 
458 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  43.7 
 
 
256 aa  239  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  48.22 
 
 
259 aa  239  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  44.09 
 
 
458 aa  238  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  44.19 
 
 
263 aa  238  5e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  44.36 
 
 
264 aa  236  4e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  43.92 
 
 
258 aa  234  9e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  43.53 
 
 
461 aa  231  7.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  43.97 
 
 
258 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  43.97 
 
 
258 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  43.97 
 
 
258 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  44.36 
 
 
263 aa  228  7e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  40.46 
 
 
262 aa  228  7e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  42.75 
 
 
459 aa  228  9e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  40.55 
 
 
258 aa  227  1e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  43.92 
 
 
257 aa  226  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  44.53 
 
 
257 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  46.12 
 
 
257 aa  227  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  46.43 
 
 
254 aa  227  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  42.23 
 
 
271 aa  227  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  45.63 
 
 
258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  43.65 
 
 
258 aa  224  8e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  43.58 
 
 
257 aa  223  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  45.74 
 
 
263 aa  221  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  44.31 
 
 
256 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  40.16 
 
 
457 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  46.06 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  40.78 
 
 
255 aa  219  3e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0206  Mg-dependent DNase  43.53 
 
 
256 aa  219  3e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000791491  normal  0.0173908 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  44.49 
 
 
259 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  40.78 
 
 
264 aa  218  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  42.53 
 
 
263 aa  218  7e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  40.64 
 
 
256 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  43.82 
 
 
267 aa  218  8.999999999999998e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  44.57 
 
 
263 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  43.25 
 
 
252 aa  216  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  41.76 
 
 
265 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  41.04 
 
 
256 aa  216  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  42.8 
 
 
262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  42.91 
 
 
263 aa  215  7e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  40.08 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  43.36 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  39.76 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  44.19 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  41.18 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  40.23 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  42.8 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  43.02 
 
 
265 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  41.96 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  41.96 
 
 
255 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  41.96 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  43.19 
 
 
264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  43.31 
 
 
251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  44.53 
 
 
262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  42.46 
 
 
261 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  39.3 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  41.18 
 
 
454 aa  211  5.999999999999999e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  41.57 
 
 
255 aa  212  5.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  42 
 
 
265 aa  212  5.999999999999999e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  41.34 
 
 
269 aa  211  7e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0211  TatD family hydrolase  39.92 
 
 
269 aa  211  7.999999999999999e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  39.76 
 
 
268 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  40 
 
 
258 aa  210  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>