More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0024 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  100 
 
 		 214 aa  431  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  75.71 
 
 		 210 aa  340  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  57.49 
 
 		 208 aa  263  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  55.56 
 
 		 208 aa  256  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  55.56 
 
 		 208 aa  256  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  55.56 
 
 		 208 aa  254  7e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  55.56 
 
 		 208 aa  254  7e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  55.56 
 
 		 208 aa  254  7e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  55.56 
 
 		 208 aa  254  7e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  55.56 
 
 		 208 aa  254  7e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  55.56 
 
 		 208 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  55.56 
 
 		 208 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  55.07 
 
 		 208 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  54.07 
 
 		 213 aa  239  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  55.07 
 
 		 211 aa  238  5e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  55.39 
 
 		 213 aa  232  4.0000000000000004e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  54.59 
 
 		 203 aa  223  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  53.14 
 
 		 211 aa  221  4.9999999999999996e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  51.92 
 
 		 217 aa  214  5.9999999999999996e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  50.97 
 
 		 205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  50.97 
 
 		 205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  52.91 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  50.96 
 
 		 213 aa  207  9e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  46.89 
 
 		 213 aa  184  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  46.86 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  44.22 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  46.11 
 
 		 671 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  46.86 
 
 		 216 aa  178  4.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  42.64 
 
 		 206 aa  177  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  50.26 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  46.12 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  44.23 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  46.46 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  42.65 
 
 		 213 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  46.41 
 
 		 207 aa  171  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  44.81 
 
 		 707 aa  170  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  46.63 
 
 		 686 aa  169  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  43.19 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  43.48 
 
 		 212 aa  168  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  45.23 
 
 		 703 aa  168  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  45.85 
 
 		 214 aa  167  8e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  45.73 
 
 		 705 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  42.72 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  44.23 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  42.08 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  42.11 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  42.72 
 
 		 217 aa  165  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  40.98 
 
 		 211 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  48.77 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  42.92 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  40.98 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  45.19 
 
 		 210 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  44.17 
 
 		 225 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  45.64 
 
 		 210 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  41.79 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  43.94 
 
 		 686 aa  159  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  43.72 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  45.67 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  43.06 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  43.33 
 
 		 901 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  44.39 
 
 		 206 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  40.2 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  45.1 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  43.66 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  45.13 
 
 		 205 aa  158  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  43.9 
 
 		 208 aa  158  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  44.95 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  46.6 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  38.46 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  46.07 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  43.75 
 
 		 210 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  43.6 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 211 aa  155  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  40.48 
 
 		 215 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  45.27 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  44.39 
 
 		 688 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  42.92 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 213 aa  155  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  43.35 
 
 		 226 aa  154  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  42.86 
 
 		 226 aa  154  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  39.23 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  44 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  39.59 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  43.39 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  43.14 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  42.36 
 
 		 236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  40.4 
 
 		 707 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  42.72 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  41.83 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  47.69 
 
 		 210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  38.46 
 
 		 236 aa  151  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  42.11 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  43.88 
 
 		 688 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  42.58 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  44.33 
 
 		 662 aa  149  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  44.67 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  40.51 
 
 		 234 aa  148  7e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  40.91 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  42.72 
 
 		 244 aa  147  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>