More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0014 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  85.05 
 
 		 428 aa  777    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  100 
 
 		 428 aa  877    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  55.24 
 
 		 430 aa  504  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  54.31 
 
 		 430 aa  495  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  54.55 
 
 		 430 aa  498  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  54.31 
 
 		 430 aa  495  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  53.85 
 
 		 430 aa  494  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  53.85 
 
 		 430 aa  494  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  53.85 
 
 		 430 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  54.08 
 
 		 430 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  54.08 
 
 		 430 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  53.85 
 
 		 430 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  42.35 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  43.62 
 
 		 426 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  50 
 
 		 342 aa  336  5e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  39.86 
 
 		 390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  38.08 
 
 		 423 aa  285  8e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  38.39 
 
 		 430 aa  280  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  36.13 
 
 		 420 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  31.35 
 
 		 316 aa  176  9e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  29.59 
 
 		 374 aa  163  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.85 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  27.49 
 
 		 503 aa  156  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  29.01 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  28.9 
 
 		 426 aa  149  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  29.97 
 
 		 307 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  34.19 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  29.15 
 
 		 312 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  25.75 
 
 		 384 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  30.97 
 
 		 793 aa  125  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.93 
 
 		 1115 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.53 
 
 		 1115 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  28.62 
 
 		 418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01642  glycosyl hydrolase, family 18  27.27 
 
 		 343 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  27.91 
 
 		 426 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.28 
 
 		 1115 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  23.28 
 
 		 1119 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  27.83 
 
 		 427 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  22.95 
 
 		 1115 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0196  glycoside hydrolase family 18  26.63 
 
 		 358 aa  111  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  30.64 
 
 		 647 aa  107  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0242  glycoside hydrolase family 18  28.62 
 
 		 484 aa  106  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000747076  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1926  glycoside hydrolase family protein  25.83 
 
 		 356 aa  104  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00103696  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2002  hypothetical protein  26.49 
 
 		 356 aa  103  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00113016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  29.63 
 
 		 688 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  27.39 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  22.59 
 
 		 927 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  27.21 
 
 		 542 aa  98.2  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3749  glycoside hydrolase family protein  23.51 
 
 		 567 aa  93.2  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.634589  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0489  glycoside hydrolase family 18  23.86 
 
 		 579 aa  90.9  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  44.33 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  25.32 
 
 		 1118 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  23.95 
 
 		 1124 aa  80.5  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  41 
 
 		 327 aa  79.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  24.31 
 
 		 583 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  31.25 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  36.81 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  23.22 
 
 		 1154 aa  76.3  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  35.05 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2862  glycoside hydrolase family protein  27.19 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.766607  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3919  chitinase II  24.6 
 
 		 695 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00105192  normal  0.0100672 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1708  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 286 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0335669  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03571  LysM domain-containing protein  28.87 
 
 		 253 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1760  glycoside hydrolase family 18  25.82 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  43.4 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  30.48 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  25.54 
 
 		 1101 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  37.11 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2210  hypothetical protein  26.84 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.179103  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 620 aa  68.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  21.26 
 
 		 521 aa  67.8  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  35.96 
 
 		 546 aa  67  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.76 
 
 		 617 aa  66.6  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 1079 aa  66.6  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  34.55 
 
 		 390 aa  67  0.0000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  39.58 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  34.19 
 
 		 633 aa  66.2  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  36.04 
 
 		 539 aa  66.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  38 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  33.66 
 
 		 173 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  31.48 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  39.78 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  22.05 
 
 		 587 aa  64.3  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  32.43 
 
 		 546 aa  63.5  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  26.87 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04231  LysM domain-containing protein  31.43 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  34.21 
 
 		 453 aa  63.2  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  32.67 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  34.23 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.4 
 
 		 637 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0336  peptidoglycan-binding LysM  26.67 
 
 		 256 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.230507  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  25.83 
 
 		 287 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  31.87 
 
 		 1021 aa  62  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  40.21 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  39.18 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  34.26 
 
 		 290 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  39.6 
 
 		 289 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  34.74 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3656  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.4 
 
 		 593 aa  61.6  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106561  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  33.88 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>