31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_R0120 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_R0120  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0115  tRNA-Ala  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0016  tRNA-Ala  91.07 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0028  tRNA-Ala  88.24 
 
 
73 bp  54  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.148209  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0028  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2090  tRNA-Ala  83.56 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.864431  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  83.56 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0057  tRNA-Ala  83.56 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121136  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1766  tRNA-Ala  83.56 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0014  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.20827  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28340  tRNA-Ala  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.146579 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00080  tRNA-Ala  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000907858  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04600  tRNA-Ala  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0057  tRNA-Ala  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.117051  hitchhiker  0.00489854 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0041  tRNA-Ala  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0002  tRNA-Ala  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000555494 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0012  tRNA-Val  96.15 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.55477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0051  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114614  normal  0.0557031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0055  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100813  normal  0.0566569 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0053  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113148  normal  0.0557031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0049  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0385641  normal  0.0854931 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0047  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0721509  normal  0.0848173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0045  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000428882  hitchhiker  0.00000000692947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0036  tRNA-Ala  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274154  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0085  tRNA-Ala  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00934773  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0077  tRNA-Ala  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000402465  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0069  tRNA-Ala  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0057  tRNA-Ala  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288839  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0037  tRNA-Ala  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000412611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0013  tRNA-Ala  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000457589  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0003  tRNA-Ala  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00193312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>