278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_R0092 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_R0092  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000423712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0110  tRNA-Gly  95.77 
 
 		 71 bp  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0081  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 71 bp  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0459508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0064  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0017  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000450697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0088  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 71 bp  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0052  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000802106  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0086  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795168  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0077  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000693473  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0071  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000022788  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0071  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000447795  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt10  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt10  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0026  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0032  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000435638  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0032  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000507298  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0001  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25240  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt05  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt05  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0032  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.274432  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0004  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.017851 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0029  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000023442  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0025  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0040  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.983411  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00109047  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.951593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0011  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.881169  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1135  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276183  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0080  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0054  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.809782  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0036  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.048485  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0013  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0030  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000137956  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1005  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000280162  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0062  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0059  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0049  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  0.991667 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0037  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0084  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2370  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00487087  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0061  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.944304  normal  0.76215 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3055  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379519  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0744  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0025  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.458906 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555629  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3118  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2577  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0033  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.544366 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1514  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0267785  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0025  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.633427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0008  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0353733  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0025  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0024  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0781725  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2036  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3090  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20543  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0008  tRNA-Gly  89.23 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.612025 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0024  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0003  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760714  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0025  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.896099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0001  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0149399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0003  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35500  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0309  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0004  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0005  tRNA-Gly  86.57 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000162881  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0057  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0030  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0538391 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0060  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0005  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000107449  hitchhiker  0.00000669742 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1872  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0196085  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0318  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000203347  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0032  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0004  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0263126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0028  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0057  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0057  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309383  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120568 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0007  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.864337  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309207  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309190  tRNA-Gly  86.89 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.179054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0017  tRNA-Gly  86.89 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.162954  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309344  tRNA-Gly  86.89 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0028  tRNA-Gly  91.11 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0010  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt09  tRNA-Gly  85.94 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000184169  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0032  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0044  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4305  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0044  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0022  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0046  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>