More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_R0032 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_R0032  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0117  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0038  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  94.67 
 
 
75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  94.67 
 
 
75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0025  tRNA-Asn  95.59 
 
 
72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.691429  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5800  tRNA-Asn  93.33 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00845439  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5647  tRNA-Asx  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5656  tRNA-Asx  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5705  tRNA-Asx  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918639  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5713  tRNA-Asx  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.423008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0269  tRNA-Asn  93.33 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  93.33 
 
 
78 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  93.33 
 
 
78 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0717839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  93.33 
 
 
78 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0120777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  93.33 
 
 
78 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000216624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  93.33 
 
 
78 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  93.33 
 
 
78 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  93.33 
 
 
78 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  93.33 
 
 
78 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00125687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  93.33 
 
 
78 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000687099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  93.33 
 
 
78 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000262097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  93.33 
 
 
78 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.449639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  93.33 
 
 
78 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234243  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0231  tRNA-Asn  93.33 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00193561  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0796  tRNA-Glu  93.33 
 
 
153 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.41258e-33 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000965695  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5053  tRNA-Asn  93.33 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000166826  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0291  tRNA-Asn  93.33 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0188  tRNA-Asn  93.33 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0871  tRNA-Glu  93.33 
 
 
153 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000806064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0167  tRNA-Asn  93.33 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641958 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5650  tRNA-Asn  93.33 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000564406  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0033  tRNA-Asn  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000091972  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4560  tRNA-Glu  93.33 
 
 
153 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000215336  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0111  tRNA-Asn  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00999623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0120  tRNA-Asn  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0074  tRNA-Asn  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0124  tRNA-Asn  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0115  tRNA-Asn  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0042  tRNA-Asn  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000134576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5663  tRNA-Asn  93.33 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000092576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5015  tRNA-Asn  93.33 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0225437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5743  tRNA-Glu  93.33 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000765198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4984  tRNA-Asn  93.33 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0042  tRNA-Asn  93.06 
 
 
72 bp  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000233042  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  92.96 
 
 
75 bp  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5671  tRNA-Asx  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000157902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4777  tRNA-Asn  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000213851  hitchhiker  0.0000000000000219436 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0600  tRNA-Asn  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000379275  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  92 
 
 
78 bp  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000140923  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  92 
 
 
78 bp  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.043106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  92 
 
 
78 bp  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000206575  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0524  tRNA-Asn  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4385300000000005e-28 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000655937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5148  tRNA-Asn  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000015109  normal  0.479478 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0033  tRNA-Asn  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.104706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5706  tRNA-Asn  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000905345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0077  tRNA-Asn  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000930167  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0043  tRNA-Asn  92.75 
 
 
75 bp  97.6  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.696161 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0028  tRNA-Asn  92.75 
 
 
75 bp  97.6  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246384  normal  0.65431 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0014  tRNA-Asn  92.65 
 
 
72 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.11083 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0044  tRNA-Asn  92.65 
 
 
72 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0403004  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0015  tRNA-Asn  92.65 
 
 
72 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0005  tRNA-Asn  92.65 
 
 
72 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.570068 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0078  tRNA-Asn  91.55 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAsnVIMSS1309217  tRNA-Asn  96.36 
 
 
72 bp  93.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0030  tRNA-Asn  96.36 
 
 
72 bp  93.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693953  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0036  tRNA-Asn  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0031  tRNA-Asn  91.55 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000375909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0027  tRNA-Asn  91.55 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000161448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0008  tRNA-Asn  94.92 
 
 
72 bp  93.7  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0026  tRNA-Asn  91.55 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000025046  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0078  tRNA-Asn  91.55 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAsnVIMSS1309370  tRNA-Asn  96.36 
 
 
72 bp  93.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0031  tRNA-Asn  91.55 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000435649  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0037  tRNA-Asn  91.3 
 
 
75 bp  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148342  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0034  tRNA-Asn  91.3 
 
 
75 bp  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.171102  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0043  tRNA-Asn  91.3 
 
 
75 bp  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0112314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0028  tRNA-Asn  91.3 
 
 
75 bp  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0045  tRNA-Asn  91.18 
 
 
72 bp  87.7  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000031214  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0054  tRNA-Asn  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0039  tRNA-Asn  90.14 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092174  hitchhiker  0.00180785 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0083  tRNA-Asn  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233313  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0042  tRNA-Asn  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0090  tRNA-Asn  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0029  tRNA-Asn  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0029  tRNA-Asn  90.14 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0127801  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0055  tRNA-Asn  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0338402  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt06  tRNA-Asn  89.86 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00593265  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0064  tRNA-Asn  89.86 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187513  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0034    89.86 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.025116  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0033  tRNA-Asn  89.86 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00239768  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0589  tRNA-Asn  89.86 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0682  tRNA-Asn  89.86 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000249623  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0649  tRNA-Asn  89.86 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000525296  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  89.71 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>