292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3468 on replicon NC_012794
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
283 aa  568  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  83.33 
 
 
281 aa  477  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  58.97 
 
 
451 aa  318  5e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  60.73 
 
 
461 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  61.13 
 
 
461 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  61.13 
 
 
461 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  60.73 
 
 
461 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  60.73 
 
 
461 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  51.44 
 
 
348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  45.93 
 
 
390 aa  254  8e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  49 
 
 
294 aa  250  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  43.86 
 
 
406 aa  247  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  47.91 
 
 
320 aa  246  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3555  beta-lactamase domain-containing protein  46.83 
 
 
300 aa  236  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000166822  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  47.08 
 
 
318 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  45.85 
 
 
352 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  44.13 
 
 
284 aa  232  6e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  46.75 
 
 
291 aa  223  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  46.75 
 
 
292 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1849  metallo-beta-lactamase family protein  40.44 
 
 
286 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000969274  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  42.15 
 
 
451 aa  202  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2771  beta-lactamase domain-containing protein  37.28 
 
 
367 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  37.79 
 
 
443 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  39.53 
 
 
454 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  40.23 
 
 
295 aa  195  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  37.4 
 
 
502 aa  188  8e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  38.96 
 
 
421 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  37.94 
 
 
453 aa  178  1e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0044  beta-lactamase-like protein  38 
 
 
291 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2772  beta-lactamase-like  35.13 
 
 
257 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.619488  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.37 
 
 
780 aa  169  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  38.76 
 
 
791 aa  168  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  37.08 
 
 
300 aa  168  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  37.04 
 
 
300 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0389  hypothetical protein  35.69 
 
 
336 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.211147  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4102  beta-lactamase domain protein  33.83 
 
 
386 aa  166  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  37.15 
 
 
300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  37.07 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.29 
 
 
818 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.71 
 
 
808 aa  162  8.000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  35.08 
 
 
300 aa  161  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1314  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 
363 aa  161  9e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  35.48 
 
 
300 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  35.8 
 
 
300 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  35.8 
 
 
300 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  35.8 
 
 
300 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  35.8 
 
 
300 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  35.8 
 
 
300 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2727  beta-lactamase domain protein  35.69 
 
 
374 aa  159  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  38.31 
 
 
778 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.36 
 
 
773 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.54 
 
 
809 aa  159  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.98 
 
 
773 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  39.53 
 
 
773 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.34 
 
 
761 aa  156  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  39.53 
 
 
654 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.7 
 
 
840 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  35.27 
 
 
795 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1520  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  36.8 
 
 
746 aa  154  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.02 
 
 
789 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.07 
 
 
775 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.41 
 
 
773 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.21 
 
 
795 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.63 
 
 
749 aa  152  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.77 
 
 
796 aa  151  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.28 
 
 
750 aa  151  8.999999999999999e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  38.74 
 
 
773 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.02 
 
 
682 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  39.53 
 
 
772 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  39.53 
 
 
772 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.33 
 
 
786 aa  149  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1867  beta-lactamase domain protein  36.16 
 
 
477 aa  149  7e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0121854 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.31 
 
 
773 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.36 
 
 
773 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.36 
 
 
759 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.19 
 
 
814 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  33.2 
 
 
479 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  38.43 
 
 
752 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2499  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.98 
 
 
783 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304772 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3048  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  38.72 
 
 
679 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.2 
 
 
770 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.13 
 
 
757 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0140  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.9 
 
 
868 aa  138  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038467 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0782  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.99 
 
 
745 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.87 
 
 
794 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.74 
 
 
797 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.96 
 
 
798 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1942  beta-lactamase-like  34.02 
 
 
423 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1579  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.31 
 
 
883 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0482933  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.55 
 
 
771 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2283  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  34.78 
 
 
342 aa  130  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  31.39 
 
 
872 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2092  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  32.64 
 
 
331 aa  122  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.214294  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.9 
 
 
778 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3143  copper amine oxidase domain-containing protein  31.84 
 
 
455 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.700617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2593  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.94 
 
 
767 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1270  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.89 
 
 
767 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.791158  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.47 
 
 
839 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2686  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.94 
 
 
767 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00549034  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0963  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.71 
 
 
840 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116554  normal  0.0504124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>