175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3443 on replicon NC_012794
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  100 
 
 		 445 aa  893    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0658  restriction modification system DNA specificity domain protein  38.79 
 
 		 473 aa  279  8e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0640  restriction modification system DNA specificity subunit  34.98 
 
 		 447 aa  233  5e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0277  hypothetical protein  32.81 
 
 		 474 aa  229  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1860  type I restriction enzyme, S subunit  30.84 
 
 		 474 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0504746  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  32.37 
 
 		 432 aa  208  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0264  restriction modification system DNA specificity subunit  34.58 
 
 		 407 aa  190  5e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  30.73 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19070  hypothetical protein  29.75 
 
 		 425 aa  170  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0871344 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  26.93 
 
 		 461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  28.2 
 
 		 464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  30.04 
 
 		 437 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6260  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.18 
 
 		 441 aa  160  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  30.37 
 
 		 422 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  28.07 
 
 		 428 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1516  restriction modification system DNA specificity subunit  26.25 
 
 		 395 aa  150  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.205219 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.18 
 
 		 456 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0796  restriction modification system DNA specificity domain  30.6 
 
 		 441 aa  149  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343889 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  27.65 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1366  putative type I site-specific restriction-modification system, S subunit  28.1 
 
 		 422 aa  144  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0493853  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3571  hypothetical protein  25.11 
 
 		 458 aa  144  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2869  type I restriction-modification system, S subunit  29.58 
 
 		 448 aa  143  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0947716  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0487  restriction modification system DNA specificity subunit  27.52 
 
 		 438 aa  143  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  27.97 
 
 		 439 aa  141  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0750  putative type I restriction-modification system  30.72 
 
 		 436 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.769779  normal  0.272821 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2200  type I restriction-modification system specificity subunit  26.97 
 
 		 461 aa  139  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.844306  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0416  type I restriction-modification system S subunit  25.38 
 
 		 457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0531711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1783  restriction modification system DNA specificity subunit  27.54 
 
 		 448 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.56 
 
 		 453 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1221  restriction modification system DNA specificity subunit  27.15 
 
 		 463 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2176  restriction modification system DNA specificity subunit  26.7 
 
 		 444 aa  131  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.962317  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  24.68 
 
 		 451 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  28.06 
 
 		 413 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1481  restriction endonuclease S subunits-like protein  26.87 
 
 		 443 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2606  restriction modification system DNA specificity subunit  29.55 
 
 		 429 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2607  restriction modification system DNA specificity subunit  26.04 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0193  type I restriction-modification system specificity determinant  24.44 
 
 		 416 aa  124  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2688  restriction endonuclease S subunits-like  25.81 
 
 		 487 aa  123  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.165356  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  30.96 
 
 		 477 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2268  putative type I restriction enzyme, S subunit  25.73 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4472  restriction modification system DNA specificity subunit  26.7 
 
 		 415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.270866  normal  0.0902542 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1327  restriction modification system DNA specificity subunit  31.43 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280518 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  22.9 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  23.11 
 
 		 456 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  25 
 
 		 462 aa  106  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1064  type I restriction-modification  24.32 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000898872  normal  0.027841 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  25.34 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  22.97 
 
 		 429 aa  104  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1366  hypothetical protein  25.05 
 
 		 462 aa  104  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2682  putative restriction endonuclease S subunit  29.17 
 
 		 400 aa  99  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.845062  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  26.87 
 
 		 439 aa  98.6  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  27.1 
 
 		 374 aa  97.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1551  type I restriction enzyme  25.17 
 
 		 439 aa  95.9  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.58 
 
 		 427 aa  96.3  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  27.4 
 
 		 425 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  26.78 
 
 		 458 aa  93.6  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  26.08 
 
 		 435 aa  92.8  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  27.25 
 
 		 425 aa  90.5  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  28.57 
 
 		 425 aa  90.1  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0455  restriction modification system DNA specificity subunit  34.67 
 
 		 403 aa  89  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0467  restriction modification system DNA specificity subunit  34.67 
 
 		 403 aa  89  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22810  hypothetical protein  22.89 
 
 		 418 aa  87.8  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2409  restriction modification system DNA specificity subunit  21.89 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.23 
 
 		 442 aa  80.1  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  25.72 
 
 		 429 aa  79.7  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0988  type I restriction-modification system, S subunit  25.66 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13680  hypothetical protein  21.77 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.247083  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  23.88 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05614  type I restriction-modification system S subunit  22.43 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  25.89 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.38 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  28.06 
 
 		 799 aa  70.1  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3569  restriction modification system DNA specificity domain  24.16 
 
 		 395 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185936  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0944  restriction modification system DNA specificity subunit  22.4 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000962716  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0429  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.64 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1526  restriction endonuclease S subunits-like  26.64 
 
 		 386 aa  67  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.65 
 
 		 423 aa  67  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  28.35 
 
 		 446 aa  67  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  23.3 
 
 		 453 aa  67  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2421  restriction modification system DNA specificity subunit  20.63 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4930  type I restriction enzyme StySJI specificity protein  22.13 
 
 		 469 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  23.16 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1158  restriction modification system DNA specificity subunit  25.96 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000117149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1015  restriction modification system DNA specificity subunit  21.51 
 
 		 575 aa  64.3  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2698  restriction modification system DNA specificity subunit  50.91 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0854775  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.57 
 
 		 477 aa  63.5  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0041  restriction-modification enzyme subunit s3b  24.41 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.370047  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0564  restriction modification system DNA specificity subunit  21.92 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00017151  decreased coverage  6.20122e-17 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.74 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1091  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.37 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  20.49 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3649  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.45 
 
 		 464 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4042  restriction modification system DNA specificity subunit  19.8 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0735  restriction modification system DNA specificity subunit  21.72 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3653  type I restriction enzyme StySPI specificity protein  21.33 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234587  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  25.32 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  23.61 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1492  restriction modification system DNA specificity subunit  21.85 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2093  restriction modification system DNA specificity subunit  20.29 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0900  restriction modification system DNA specificity domain protein  20.4 
 
 		 471 aa  57  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.963501 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>