194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3433 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  100 
 
 
116 aa  233  8e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  83.33 
 
 
121 aa  197  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  70.64 
 
 
115 aa  161  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  70.64 
 
 
115 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  70.64 
 
 
115 aa  159  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  70.64 
 
 
119 aa  159  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  70.64 
 
 
119 aa  159  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  70.64 
 
 
119 aa  159  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  70.64 
 
 
119 aa  159  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  70.64 
 
 
119 aa  159  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  70.64 
 
 
115 aa  159  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  69.72 
 
 
115 aa  157  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  70.64 
 
 
115 aa  156  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  49.14 
 
 
117 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  49.14 
 
 
117 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  54.05 
 
 
109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  49.14 
 
 
115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  47.75 
 
 
117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  50 
 
 
111 aa  111  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  50.94 
 
 
117 aa  104  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  46.09 
 
 
122 aa  104  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  46.49 
 
 
116 aa  103  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  43.36 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  33.93 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  40.19 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  42.11 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  40 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  36.7 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  39.58 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  30.7 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  33.94 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  33.94 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  31.19 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  36.11 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  36.63 
 
 
116 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  37.5 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  33.33 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  33.33 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  33.33 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  35.71 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  32.43 
 
 
130 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  34.48 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  43.02 
 
 
119 aa  60.8  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  31.78 
 
 
114 aa  60.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  32.11 
 
 
121 aa  60.5  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  34.78 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  35.78 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  34.21 
 
 
119 aa  58.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  34.21 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  37 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  31.62 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  41.3 
 
 
110 aa  58.9  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  37.63 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  39.45 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  36.05 
 
 
116 aa  57.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0552  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  36.05 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  31.82 
 
 
110 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  32 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  36.05 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0983  ribonuclease P protein component  32.14 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162194  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  29.63 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1829  ribonuclease P protein component  39.44 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0821  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 
108 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  32.71 
 
 
135 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4508  ribonuclease P protein component  40.96 
 
 
170 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1040  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 
108 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0513155  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  31.78 
 
 
126 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  33.64 
 
 
162 aa  53.5  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0552  ribonuclease P protein component  40 
 
 
81 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  29.09 
 
 
125 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  30.16 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  32.73 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2237  ribonuclease P protein component  38 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  34.23 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  36.28 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03486  ribonuclease P protein component  40.28 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  38.27 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  38.27 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  32.95 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  30.58 
 
 
132 aa  51.6  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2315  ribonuclease P  32.35 
 
 
121 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  34.15 
 
 
130 aa  51.2  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  33.62 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  32.11 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  38.04 
 
 
162 aa  50.4  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  33.64 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  38.16 
 
 
133 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2225  ribonuclease P  32.35 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  31.45 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  33.63 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  36.84 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  31.4 
 
 
180 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  32.95 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  26.96 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  29 
 
 
123 aa  48.9  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  35.37 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.250922 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>