More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3416 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  100 
 
 		 164 aa  336  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  89.02 
 
 		 164 aa  301  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  70.76 
 
 		 170 aa  234  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  70.59 
 
 		 169 aa  231  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  69.36 
 
 		 173 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  69.36 
 
 		 173 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  71.93 
 
 		 164 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  69.36 
 
 		 173 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  69.36 
 
 		 173 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  68.79 
 
 		 173 aa  229  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  69.19 
 
 		 172 aa  228  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  69.19 
 
 		 172 aa  228  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  68.6 
 
 		 172 aa  226  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  62.28 
 
 		 167 aa  194  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  62.28 
 
 		 167 aa  194  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  61.14 
 
 		 169 aa  191  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  59.28 
 
 		 163 aa  186  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  60.37 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  60.37 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  60.37 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  60.37 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  54.95 
 
 		 172 aa  184  7e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  55.17 
 
 		 172 aa  180  7e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  59.17 
 
 		 166 aa  180  9.000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  52.1 
 
 		 138 aa  178  2.9999999999999997e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  51.32 
 
 		 188 aa  173  7e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  57.93 
 
 		 142 aa  173  8e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  57.93 
 
 		 142 aa  173  8e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  48.94 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  53.66 
 
 		 138 aa  168  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  53.66 
 
 		 156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  53.94 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  58.21 
 
 		 137 aa  156  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  50.61 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  59.06 
 
 		 185 aa  153  8e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  61.82 
 
 		 119 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  61.11 
 
 		 114 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  48.19 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  49.7 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  58.49 
 
 		 111 aa  140  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  58.49 
 
 		 111 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  57.55 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  58.49 
 
 		 112 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  57.55 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  57.55 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  57.55 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  57.55 
 
 		 111 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  57.55 
 
 		 111 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  48.48 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2003  single-stranded DNA-binding protein  55.66 
 
 		 112 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000170314  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  51.03 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  55.66 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  60.19 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  45.73 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  58.04 
 
 		 140 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  45.45 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  51.47 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  57.01 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  45.45 
 
 		 140 aa  123  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  45.45 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0180  single-stranded DNA-binding protein  50.89 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  47.22 
 
 		 129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  53.33 
 
 		 161 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  50 
 
 		 142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  39.43 
 
 		 174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  45.97 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  40.61 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1821  single-stranded DNA-binding protein  50.88 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  45.24 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  48.08 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  43.17 
 
 		 143 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0811  single-strand binding protein  42.74 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000022437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  47.12 
 
 		 146 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  43.41 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  43.41 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  43.33 
 
 		 146 aa  104  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  39.16 
 
 		 149 aa  103  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  37.34 
 
 		 160 aa  103  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  47.12 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  44.86 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  44.86 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  46.15 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  44.34 
 
 		 134 aa  102  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  44.55 
 
 		 135 aa  101  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 		 135 aa  101  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  49.47 
 
 		 114 aa  101  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  49.47 
 
 		 114 aa  101  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  43.52 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  35.76 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  44.86 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  50.5 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  36.67 
 
 		 139 aa  99.4  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  45.79 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  38.13 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  45.71 
 
 		 135 aa  99.4  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  44.23 
 
 		 167 aa  98.6  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 180 aa  98.6  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 161 aa  97.8  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  37.59 
 
 		 148 aa  97.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>