More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3415 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  100 
 
 
78 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  93.51 
 
 
77 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  92.21 
 
 
77 aa  147  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  92.21 
 
 
77 aa  147  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  92.21 
 
 
77 aa  147  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  92.21 
 
 
77 aa  147  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  90.91 
 
 
77 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  90.91 
 
 
77 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  90.91 
 
 
77 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  90.91 
 
 
77 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  90.91 
 
 
77 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  90.91 
 
 
77 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  98.46 
 
 
78 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  86.57 
 
 
80 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  85.07 
 
 
80 aa  123  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  85.07 
 
 
80 aa  123  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 
79 aa  105  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  78.79 
 
 
77 aa  105  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  68 
 
 
81 aa  104  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  65.33 
 
 
79 aa  103  7e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  69.23 
 
 
78 aa  102  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 
75 aa  101  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  65.22 
 
 
76 aa  100  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  65.22 
 
 
76 aa  100  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3481  30S ribosomal protein S18  66.18 
 
 
98 aa  99.4  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.26859  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  74.19 
 
 
76 aa  98.6  3e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  68.18 
 
 
75 aa  97.8  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  69.7 
 
 
94 aa  97.8  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  69.23 
 
 
74 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  64.29 
 
 
94 aa  96.7  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1218  SSU ribosomal protein S18P  62.67 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1667  30S ribosomal protein S18  60.87 
 
 
92 aa  95.9  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088074  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0026  30S ribosomal protein S18  70.31 
 
 
75 aa  95.9  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  60.56 
 
 
74 aa  94.4  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3667  30S ribosomal protein S18  61.64 
 
 
91 aa  94.4  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0312817  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4964  30S ribosomal protein S18  67.65 
 
 
86 aa  94  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  62.67 
 
 
89 aa  93.2  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  58.44 
 
 
97 aa  92.8  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2008  30S ribosomal protein S18  63.24 
 
 
83 aa  93.2  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.922346  normal  0.649382 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  64.62 
 
 
75 aa  93.2  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1949  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
94 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.879875  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0740  ribosomal protein S18  61.76 
 
 
87 aa  93.2  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0452122  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3282  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 
75 aa  92.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0561913  hitchhiker  0.000203056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  68.18 
 
 
90 aa  92  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 
96 aa  92  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  59.42 
 
 
74 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4210  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 
75 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.882361  hitchhiker  0.000251035 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  65.62 
 
 
76 aa  92  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2103  30S ribosomal protein S18  60.87 
 
 
95 aa  91.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.499514  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 
75 aa  91.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0759  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 
75 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  hitchhiker  0.000000223269 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3584  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 
75 aa  91.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173791  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 
75 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 
75 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  62.12 
 
 
76 aa  91.3  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 
75 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0755  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 
75 aa  91.3  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000506389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0734  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 
75 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213573  hitchhiker  0.0000000101296 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 
75 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3258  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 
75 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000185776  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0689  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 
75 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00223713  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 
75 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0113  30S ribosomal protein S18  66.15 
 
 
96 aa  90.9  6e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2592  30S ribosomal protein S18  62.69 
 
 
83 aa  90.5  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  64.62 
 
 
75 aa  90.1  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
75 aa  90.1  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6994  ribosomal protein S18  59.09 
 
 
88 aa  89.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09983  ribosomal protein S18  57.97 
 
 
100 aa  90.1  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.596989  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0398  30S ribosomal protein S18  54.79 
 
 
83 aa  89.7  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
74 aa  89.4  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0913  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 
91 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.317596 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  64.06 
 
 
88 aa  89.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  57.89 
 
 
80 aa  89.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  57.89 
 
 
80 aa  89.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  67.19 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  60.61 
 
 
74 aa  89.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 
106 aa  89.4  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04069  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3791  ribosomal protein S18  62.12 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00509801  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4661  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4446  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 
92 aa  89.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0373  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4672  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.998059 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3811  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5717  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.375297  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4753  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0729519  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04031  hypothetical protein  62.12 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4811  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0274683  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4763  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2454  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
91 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427357  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4735  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260572  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  88.6  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0776  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000892175  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3349  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 
75 aa  89  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000024458  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4671  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00669693  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4789  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3590  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.307968  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0796  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000510602  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2588  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 
76 aa  88.6  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.752864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>