32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3414 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3414  IG hypothetical 15508  100 
 
 
308 aa  604  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00386324  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3543  hypothetical protein  66.56 
 
 
308 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4011  hypothetical protein  36.57 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0458856  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5152  hypothetical protein  34.95 
 
 
312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000091778  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5168  hypothetical protein  34.95 
 
 
312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.190571  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5659  hypothetical protein  34.63 
 
 
312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5581  hypothetical protein  34.63 
 
 
312 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.747160000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5264  hypothetical protein  33.98 
 
 
311 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5324  hypothetical protein  34.95 
 
 
312 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5720  hypothetical protein  34.95 
 
 
312 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000676136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5622  hypothetical protein  34.3 
 
 
311 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5337  hypothetical protein  34.95 
 
 
311 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000137644  hitchhiker  0.000000122299 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5598  hypothetical protein  34.63 
 
 
311 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0121359  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0653  membrane protein-like protein  25.78 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.547059  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2912  membrane protein-like protein  25.4 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185591  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2762  hypothetical protein  28.42 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0013  hypothetical protein  23.21 
 
 
312 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0013  hypothetical protein  23.21 
 
 
312 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1478  hypothetical protein  28.08 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443079 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2540  hypothetical protein  25.26 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23330  predicted membrane protein  26.71 
 
 
295 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000027962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2390  hypothetical protein  21.64 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000143216  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0667  hypothetical protein  22.15 
 
 
314 aa  49.3  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2842  hypothetical protein  26.37 
 
 
315 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139293  hitchhiker  0.000000000000178909 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3304  membrane protein-like protein  23.57 
 
 
319 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3186  hypothetical protein  21.79 
 
 
325 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.46732  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2974  hypothetical protein  21.32 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.324632  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1360  hypothetical protein  23.81 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000257094  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4352  membrane protein-like protein  24.45 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2652  hypothetical protein  21 
 
 
331 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0372503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0131  membrane protein-like  20.8 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0867832  normal  0.324559 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3676  hypothetical protein  21.36 
 
 
314 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>