20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3407 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3536  YycH family protein  66.15 
 
 
442 aa  655    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3407  YycH family protein  100 
 
 
449 aa  919    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5257  YycH family protein  35.85 
 
 
443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5161  hypothetical protein  37.05 
 
 
438 aa  249  8e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5648  YycH protein  36.64 
 
 
438 aa  247  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4004  YycH family protein  35.48 
 
 
446 aa  246  4e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.930687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5613  YycH protein  36.64 
 
 
440 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5348  YycH protein  36.89 
 
 
438 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000246614  hitchhiker  0.0000000000000557991 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5587  YycH protein  36.97 
 
 
438 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.825694  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5713  hypothetical protein  36.17 
 
 
438 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5145  hypothetical protein  36.17 
 
 
438 aa  240  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5570  YycH protein  36.17 
 
 
440 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35171e-33 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5317  YycH protein  36.17 
 
 
438 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0020  hypothetical protein  21.81 
 
 
444 aa  97.4  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2532  yycH protein  20.26 
 
 
445 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0020  hypothetical protein  20.96 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0021  YycH family protein  22.77 
 
 
431 aa  78.6  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0066  hypothetical protein  20.09 
 
 
474 aa  55.1  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000449157  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1948  hypothetical protein  19.86 
 
 
430 aa  50.1  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.919018  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2920  YycH family protein  21.41 
 
 
437 aa  44.3  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>